Spatial Association of Canine Rabies Outbreak and Ecological Urban Corridors, Arequipa, Peru

Castillo-Neyra, Ricardo; Zegarra, Edith; Monroy, Ynes; Bernedo, Reyno F.; Cornejo-Rosello, Ismael; Paz-Soldán, Valerie A.; Levy, Michael Z.

doi:10.3390/tropicalmed2030038

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“…One challenge in estimating R0 for canine rabies globally is lack of accurate case counts. Rabies cases in humans are grossly underreported; in dogs, this trend is even more apparent (3,6,(28)(29)(30)(31)(32). The WHO estimated that though in 2010 less than 10 human cases were reported in Latin America, there were in reality closer to 200 (13).…”

Section: Model Descriptionmentioning

confidence: 99%

The Impact of the COVID-19 Pandemic on Rabies Reemergence in Latin America: the case of Arequipa, Peru

Raynor

Díaz

Shinnick

et al. 2020

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Over the past decades, there has been tremendous progress towards eliminating canine rabies in Latin America. Major components of rabies prevention programs in Latin America leading to these successes have been constant and intense surveillance for rabid dogs and uninterrupted yearly mass dog vaccination campaigns. However, vital measures to control COVID-19 in Latin America have had the negative trade-off of jeopardizing these rabies elimination and prevention activities. In this paper, we aimed to assess the effect of interrupting canine rabies surveillance and mass dog vaccination campaigns on rabies trends. We built a deterministic compartment model of dog rabies dynamics parameterized for conditions found in Arequipa, Peru, where there is an ongoing dog rabies epidemic. Our model suggests that a decrease in canine vaccination coverage as well as decreased surveillance leading to an increased length of survival of infected dogs could lead to a sharp rise in canine rabies and, subsequently, human rabies risk. We examined our results over the best estimate of the basic reproductive number in Arequipa (R0 = 1.44) and a range of plausible values for R0 (1.36 - 2). The rising trend was consistent. It is very possible that COVID-19 will continue to challenge our public health departments in the short- and medium-term. Innovative strategies to conduct dog vaccination and rabies surveillance during these trying times should be considered to safeguard the achievements made in Latin America towards the elimination of dog-mediated human rabies. Resumen (Abstract in Spanish) En las últimas décadas ha habido un tremendo progreso hacia la eliminación de la rabia canina en América Latina. Los principales componentes de los programas de prevención de la rabia en América Latina que condujeron a estos éxitos han sido la vigilancia constante e intensa de los perros con rabia y las campañas anuales de vacunación masiva ininterrumpida. Sin embargo, las medidas esenciales para controlar el COVID-19 en América Latina han tenido el balance negativo de poner en peligro estas actividades de prevención y eliminación de rabia. En este artículo, nuestro objetivo fue evaluar el efecto que la interrupción de la vigilancia de la rabia canina y las campañas de vacunación masiva de perros tendría en las tendencias de la rabia. Modelamos la dinámica de la rabia canina mediante un modelo determinístico de comportamientos parametrizado para las condiciones que se encuentran en Arequipa, Perú, donde hay una epidemia de rabia canina en curso. Nuestro modelo sugiere que una disminución en la cobertura de vacunación canina, así como una disminución en la vigilancia (que llevaría a una mayor supervivencia de los perros infectados), podría llevar a un aumento súbito de rabia canina y, seguidamente, del riesgo de rabia humana. Examinamos nuestros resultados sobre la mejor estimación del número reproductivo básico en Arequipa (R0 = 1.44) y un rango de valores plausibles para R0 (1.36 - 2). La tendencia al alza fue consistente. Es muy posible que el COVID-19 continúe desafiando a nuestros departamentos de salud pública a corto y mediano plazo. Por lo tanto, deben considerarse estrategias innovadoras para llevar a cabo la vacunación de perros y la vigilancia de la rabia durante estos tiempos difíciles para salvaguardar los logros alcanzados en América Latina hacia la eliminación de la rabia humana mediada por perros.

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Section: Model Descriptionmentioning

confidence: 99%

The Impact of the COVID-19 Pandemic on Rabies Reemergence in Latin America: the case of Arequipa, Peru

Raynor

Díaz

Shinnick

et al. 2020

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“…En el análisis filogenético se observó también el agrupamiento de los aislados del VR obtenidos en el periodo 2016-2017 con los aislados recuperados al inicio del brote, esta alta similitud nucleotídica posiblemente se deba a: la adaptación del virus para mantenerse en la población hospedera como ha sido reportada en estudios anteriores (24,28,29) ; al comportamiento del movimiento de la población de canes en Arequipa (30) ; o debido a la limitada variedad de especies reservorio en el área de la epizootia (31) .…”

Section: Resultsunclassified

“…En estos últimos años el departamento de Arequipa viene reportando un alto número de casos positivos de rabia canina, 58 casos en el 2016 y 48 casos en el 2017 (11) , persistencia probablemente relacionada a diversos factores: económicos, políticos, sociales y culturales (30,(32)(33)(34) . En este contexto el uso de herramientas moleculares es necesaria como soporte de la investigación epidemiológica, ya que la identificación y/o caracterización del VR circulante nos permitirá establecer vínculos filogeográficos (33) , conocer la dinámica del virus en el área epizoótica, y contribuir al diseño de estrategias para el control y prevención de rabia canina.…”

Section: Resultsunclassified

Caracterización molecular de la nucleoproteína del virus de la rabia en canes procedentes de Arequipa, Perú

Torpoco

Huallpa

Espinoza-Culupú

et al. 2019

Rev Peru Med Exp Salud Publica

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a Médico veterinario; b biólogo, magíster en Mejoramiento genético de plantas; c biólogo, magíster en Biología molecular, d médico veterinario, magíster en Medicina veterinaria preventiva. El artículo es parte de la tesis de Carina Mantari Torpoco para obtener el grado de magíster en Objetivos. Caracterizar la nucleoproteína (N) y establecer el origen del virus de la rabia en canes procedentes de Arequipa. Materiales y métodos. Se analizaron 30 muestras de tejido nervioso procedentes de los departamentos de Arequipa y Puno. Se extrajo el ARN total de las muestras y se sintetizó ADNc para amplificar el gen de la nucleoproteína, secuenciarlo y realizar el análisis bioinformático. Resultados. Se obtuvo la formación de un grupo definido con respecto al grupo externo (European bat lyssavirus). Este grupo fue clasificado en dos subgrupos, uno constituido por muestras procedentes de Puno y Arequipa (subgrupo A), y otro por muestras de Puno (subgrupo B), observándose una identidad nucleotídica de 99,9% en el subgrupo A. Conclusiones. Los agrupamientos de las secuencias virales muestran que los casos de rabia canina notificados en Arequipa son el resultado de la expansión de rabia canina procedente de la región endémica de Puno. ABSTRACTObjective. To characterize the nucleoprotein (N) and establish the origin of the rabies virus in dogs coming from Arequipa. Materials and Methods. Thirty samples of nervous tissue from the departments of Arequipa and Puno were analyzed. Total RNA was extracted from the samples and cDNA was synthesized to amplify the nucleoprotein gene, sequence it, and perform bioinformatics analysis. Results. A defined group was formed with respect to the external group (European bat lyssavirus). This group was classified into two subgroups, one constituted by samples coming from Puno and Arequipa (subgroup A), and another one by samples from Puno (subgroup B), exhibiting a nucleotide identity of 99.9% in subgroup A. This group was classified in two subgroups, one constituted by samples coming from Puno and Arequipa (subgroup A), and another one by samples from Puno (subgroup B), observing a nucleotide identity of 99.9% in subgroup A. Conclusions. The groupings of viral sequences show that the cases of canine rabies reported in Arequipa are the result of the expansion of canine rabies from the endemic region of Puno.

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“…De igual manera las características topográficas de la ciudad que incluyen formaciones de canales secos conocidos como "torrenteras" que constituyen corredores ecologicos para el movimiento de canes con rabia, y donde interaccionan poblaciones de canes con dueño y extensas poblaciones aparentemente sin dueño, muchos de ellos con canes de difícil acceso para vacunación parenteral y que fácilmente pueden ser excluidos de las campañas de vacunación canina que ocurren en puestos fijos donde los dueños llevan a sus perros a vacunar. Se ha demostrado que la probabilidad de que un perro sea llevado al puesto de vacunación disminuye con la distancia de las vivienda al puesto móvil de vacunación (8,9,10) .…”

Section: El Contexto Del Ascenso Y Caída Del Control De La Rabia Caniunclassified

Persistencia de la reemergencia de la rabia canina en el sur del Perú

Cabrera

2019

An Fac med

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En el siglo pasado la rabia canina fue endémica en nuestro país. En la década de los 1990's, el Perú implementó el plan de acción para la eliminación de la rabia urbana por recomendación de la Organización Panamericana de la Salud, logrando un control exitoso de la rabia. Pese a los esfuerzos desplegados, Puno mantuvo focos endémicos persistentes, y en el 2014, Arequipa reportó el primer evento de reintroducción de rabia urbana en Latinoamérica. El brote de rabia se intensificó en los últimos años en Arequipa, Puno y Cusco, con 19 casos de rabia canina el 2015, a 59 casos el 2016, continuando el 2017 con 47 casos, el 2018 con 46, y hasta julio del 2019, 17 casos. Así, hubo reintroducción de la rabia canina, estableciendo una situación de alta endemicidad no controlada. En el presente reporte, abordamos el contexto y persistencia de la reemergencia de la rabia canina en el sur del Perú.

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Spatial Association of Canine Rabies Outbreak and Ecological Urban Corridors, Arequipa, Peru

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The Impact of the COVID-19 Pandemic on Rabies Reemergence in Latin America: the case of Arequipa, Peru

The Impact of the COVID-19 Pandemic on Rabies Reemergence in Latin America: the case of Arequipa, Peru

Caracterización molecular de la nucleoproteína del virus de la rabia en canes procedentes de Arequipa, Perú

Persistencia de la reemergencia de la rabia canina en el sur del Perú

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