Objetivo: Determinar los factores asociados al conocimiento en enfermedades raras y huérfanas en estudiantes de medicina de la UPSJB, Lima 2022. Materiales y métodos: Estudio analítico, transversal y prospectivo. La población de estudio fueron 750 estudiantes de medicina de la UPSJB (9° a 14° ciclo). La muestra estuvo conformada por 252 estudiantes. Se utilizó el instrumento validado de conocimientos sobre las enfermedades raras de Domaradzki y Walkowiak. El procesamiento de datos se realizó a través de estadística bivariada principalmente, la prueba estadística fue el Chi2 de Pearson considerando un nivel de confianza del 95%. Resultados: Entre los participantes se tuvo una edad promedio de 25 años, y fueron mayormente del género masculino (52,4%), del último año de la carrera (53,6%) y que no tuvieron contacto con una persona con enfermedad rara (72,6%). El análisis bivariado muestra que nadie tuvo un nivel de conocimiento alto y que el 64,2% tuvo un nivel de conocimiento bajo. Además, el haber estado en contacto con una persona con enfermedad rara se asoció al nivel de conocimiento (p<0,001). Conclusiones: En nuestro estudio se encontró asociación significativa entre el contacto con una persona con ERH y el nivel de conocimiento sobre enfermedades raras y huérfanas en estudiantes de medicina de la UPSJB.