Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui struktur populasi dan laju silang dalam per generasi kerbau Moa di Pulau Moa sebagai sumber informasi tentang status populasi kerbau. Survey dilakukan terhadap 60 peternak responden yang memelihara kerbau pada tiga lokasi desa sampel, dan pengambilan data dengan jalan melakukan wawancara terhadap peternak kerbau dan pengamatan langsung di lapangan. Variabel yang diamati meliputi struktur populasi, populasi aktual, populasi efektif dan laju silang dalam per generasi. Hasil penelitian menunjukkan komposisi kerbau Moa dari populasi total adalah anak jantan 5,45% : anak betina 4,55% (1,2 : 1), muda jantan 11,27% : muda betina 10,18% (1,11 : 1), dan dewasa jantan 18,91% : dewasa betina 49,64% (1 : 2,63) ; (2) Ukuran populasi aktual kerbau Moa adalah 377 ekor, dengan ukuran populasi efektif sebesar 301 ekor ; (3) laju silang dalam (inbreeding) per generasi kerbau Moa adalah 0,16%. mengindikasikan bahwa belum terjadinya silang dalam (inbreeding).