J'adresse me remerciements au Laboratoire de Mécanique des Solides (U M R − 7649) pour m'avoir accueilli et particulièrementà son directeur Patrick Le Tallec, sans lequel ma dernière année de thèse n'aurait pasété tout simplement possible. Je voudrais adresser mes remerciementsà l'École doctorale de l'École Polytechnique où j'ai effectué cette thèse sous d'excellentes conditions. Je remercie chaleureusement mon directeur de thèse Lev Truskinovsky de m'avoir accompagné et m'avoir guidé durant ces années qui m'ont permis de poser mes premiers pas dans le domaine de la recherche scientifique. Je tiensà exprimer toute ma gratitude pour le constant partage de connaissances, son aimabilité et pour sa disponibilité et sa présence. Son apport scientifique m'a permis d'approfondir mes recherches et de m'améliorer en tant que personne. Je tienségalementà remercier Jean-Marc Allain pour ses conseils précieux apportésá ce projet. Le passage vers la recherche et la science en géneral auraitété impossible sans Pawel Pieranski dont la rencontre m'a fortement influencé. Je le remercie pour les nombreuses matinées passées ensemble durant l'étè 2007, et pour les connaissances variées qu'il m'a apporté. Je remercie Pascal Martin pour le partage de sa grande connaissance dans le domaine des moteurs molléculaires et d'avoir accepté d'évaluer ce travail. Je souhaiteégalement remercier Tony Lelièvre pour les longues heures qu'il a consacré et qui ont fortement contribué au bon déroulement de toutes mes simulations numériques. Un grand mercià vous deux pour le temps consacréà examiner ce travail. J'espère que nos conversations contribuerontà un projet commun future. Toutes mes sincères considérationsà Dominique Chapelle, Abdul Barakat qui m'ont fait l'honneur de participer au jury. Je remercie aussi Massimo Reconditi d'avoir accepté de représenter l'équipe de Vincenzo Lombardi du Laboratoire de Physiologie de Florence. Les discussions sur le thème de la contraction musculaire ont eu un important impact sur le dévellopement des idées presentées dans ce travail. A mes très estimés collègues de thèse, Matthieu Caruel et Pierre Recho. Je tiensà dire toute ma reconnaissance pour leur amitié et leur aide très stimulantes. J'espère que notre amitié et nos collaborations se poursuivront. Aussi je tiensà remercier mon collègue de bureau Paul pour nos pauses café. Et bien sûr je n'oublie pas LMS jazz band: Merci donc a Eva, Nicolas, Mathieu, Marc, Anders, Gérard, Matthieu, Gauthier et Camille. Je tienś egalementà remercier tous les thésards du LMS. A toute l'équipe du LMS et en particulier Alexandra, Christiane et Christian j'adresse un grand Merci pour leurs compétences et leur soutien dans les diverses démarches administratives et les soucis informatiques. Enfin, Je remercie ma famille pour leur soutien moral, leur encouragement et leur confiance ainsi qu'à mes amis età mes proches et une très tendre Mercià Ghalia pour sa présence et d'avoir me supporter. Contents iii 10 Synthetic model with hysteretic control 161 10.