Surveillance of eight respiratory viruses in clinical samples of pediatric patients in Southeast Brazil

Abstract

ResumoObjetivo: Detecção de oito vírus respiratórios mais comuns: vírus respiratório sincicial humano (VRSH), vírus influenza tipo A e B (IA e IB), vírus da parainfluenza 1, 2 e 3 (VPIH1, 2 e 3), adenovírus (Ad) e metapneumovírus humano (MPVH), a fim de estabelecer a etiologia das infecções respiratórias agudas (IRA) e a epidemiologia desses vírus em crianças pequenas atendidas no Hospital Universitário da Universidade de São Paulo, em São Paulo, Brasil, durante o ano de 2003. Métodos:A vigilância epidemiológica foi realizada em todas as crianças menores de 5 anos hospitalizadas por causa de doenças do trato respiratório inferior (DTRI) entre 1º de janeiro de 2003 e 20 de dezembro de 2003, no hospital universitário. Amostras coletadas de nasofaringe foram analisadas quanto à presença de vírus respiratórios através da reação em cadeia da polimerase e detectadas pelo programa GeneScan. (55.6%) were positive for at least one of the respiratory viruses studied. Of all the children, HRSV was identified in 24.1%, HMPV in 17.8%, HPIV3 in 8.3%, Ad in 6.8%, IA in 5%, HPIV1 in 0.6%, but no virus could be detected in 44.1%. Dual virus infections were detected in 7.1% of all samples (12.8% of positive samples). HPIV2 and IB were not detected in the present study. Resultados Conclusions:This study confirms that children younger than 5 years and particularly younger than 1 year have a high hospitalization rate due to HRSV, HMPV, HPIV, influenza and adenovirus. We were able to determine the etiology and epidemiology of most ARIs and trace the seasonal profile of the commonest respiratory viruses among young children. Os critérios de inclusão foram os seguintes: todas as crianças menores de 5 anos com DTRI apresentando um ou mais dos seguintes sintomas físicos: dispnéia (taxa de respiração > 50), retrações torácicas, sibilância, crepitação, estridor e cianose; além de alterações pulmonares no raio X (hiperinsuflação, condensação). Os critérios de exclusão foram: doença respiratória crônica (> 7 dias do início da DTRI); e pacientes atendidos no HU entre as 18h de sexta-feira e as 8h de segunda-feira, por razões operacionais. Coleta das amostrasO aspirado nasal foi obtido pela lavagem das narinas com solução fisiológica e pela coleta do mesmo em um frasco esté-ril até no máximo 24 h após o atendimento. Os protocolos e procedimentos para coleta das amostras foram aprovados pelo Comitê de Ética em Pesquisa do ICB-USP. Todas as amostras foram mantidas a 4 ºC e levadas ao laboratório em até 2 h após a coleta, para subseqüente extração. Prevenção de contaminação cruzada (carryover)Para reduzir a oportunidade de contaminação do fragmento amplificado, separamos o pré e os pós-ensaios em três salas diferentes, trocamos de luvas com freqüência, pré distribuímos os reagentes em alíquotas e usamos múltiplos controles em cada lote de amostras testadas. Ponteiras equipadas com filtros de vedação foram usadas para a pipetagem dos reagentes e todas as áreas e equipamentos foram descontaminados com hipoclorito de sódio antes e depois da pipetag...

Respiratory virus infections among hospitalized patients with suspected influenza A H1N1 2009 virus during the first pandemic wave in Brazil

“…H1N1 2009 was the most prevalent virus worldwide during our expected influenza season, from June to September, 19,20 and this delayed seasonal H3N2 circulation until October and early November, extending the influenza season.…”

Frequency of human metapneumovirus infection in hematopoietic SCT recipients during 3 consecutive years

“…6,7,18 Human metapneumovirus was circulated year round, but more cases were diagnosed in the winter and spring months as previously observed in other countries 20,21 and in the pediatric population of the city of Sa˜o Paulo. 22 In children, Gerna et al This alternate pattern of circulation is widely known among other RVs and suggests that hMPV may vary in genetic structure, to allow for a seasonal shift in predominant genotype and the maintenance of infection rates. 23 We conclude that the prevalence rates of hMPV infection in HSCT recipients living in Brazil are similar to those observed in the northern hemisphere.…”

Respiratory disease and climatic seasonality in children under 15 years old in a town in the Brazilian Amazon

“…Além disso, alguns vírus apresentam comportamento altamente sazonal, com maior freqüência no período frio em áreas de clima temperado e também no período de chuvas naquelas de clima tropical, como o da Amazônia legal. Esses vírus são freqüentemente causadores de DR em crianças, principalmente das vias aéreas superiores 7,8 . Entretanto, o conhecimento acerca do comportamento das DR em áreas de bioma amazônico e da possível influência dos ciclos típicos de seca e chuva sobre a saúde humana é escasso.…”