Systematyka i Analizy Genomiczne Bakterii z Rodzaju Azotobacter

Abstract

Streszczenie: Bakterie z rodzaju Azotobacter są przedmiotem wielu badań prowadzonych zarówno w Polsce jak i za granicą. Zainteresowanie tą grupą bakterii w dużej mierze związane jest z ich właściwościami, które mogą być wykorzystywane w rolnictwie. Najnowsze badania opierają się na zaawansowanych metodach molekularnych i bazują na poznanej sekwencji genomów dwóch gatunków: Azotobacter vine landii i Azotobacter chroococcum. W 2009 roku Setubal i in. opublikowali pełną sekwencję genomu Azotobacter vinelandii DJ, z kolei pełną sekwencję genomu Azotobacter chroococcum 8003 opublikowali Robson i in. w pracy z 2015 roku. Obie bakterie mają pojedynczy, kolisty chromosom o wielkości odpowiednio 5,365,318 pz. i 5,192,291 pz. Poznanie i porównanie sekwencji genomów Azotobacter vinelandii DJ i Azotobacter chroococcum 8003 pozwoliło odpowiedzieć na wiele pytań dotyczących ewolucji, różnorodności i miejsca tych bakterii w środowisku. Zsekwencjonowanie większej liczby genomów innych szczepów A. chroococcum i A. vinelandii przyniosłoby wiele korzyści i pozwoliłoby uporządkować dotychczasową wiedzę na ich temat. 1. Wstęp. 2. Pozycja taksonomiczna Azotobacter spp. 2.1. Bliskie pokrewieństwo bakterii z rodzajów Azotobacter i Pseudomonas. 2.2. Metody molekularne porównywania i grupowania bakterii w obrębie rodzaju/gatunków Azotobacter. 3. Analizy genomiczne przedstawicieli Azoto bacter spp. -szczepów Azotobacter vinelandii DJ i Azotobacter chroococcum 8003. 3.1. Porównanie genomów szczepów Azotobacter vine landii DJ i Azotobacter chroococcum 8003. 3.2. Ruchome elementy genetyczne szczepów Azotobacter vinelandii DJ i Azoto bacter chroococ cum 8003. 3.3. Charakterystyka wybranych genów szczepów Azotobacter vinelandii DJ i Azotobacter chroococcum 8003. 4. Podsumowanie SYSTEMATICS AND GENOMIC ANALYSIS OF BACTERIA OF THE GENUS