Target Kerja Obat Covid-19: Review

Purwaniati, Purwaniati; Asnawi, Aiyi

doi:10.47653/farm.v7i2.172

Cited by 6 publications

(7 citation statements)

References 14 publications

Supporting

Mentioning

Contrasting

Unclassified

Order By: Relevance

“…Evaluasi senyawa bioaktif pada tumbuhan sebagai anticovid-19 menggunakan pendekatan molecular docking berdasarkan skor docking yang dihitung menggunakan AutoDock Vina (AV) sebagai docking engine berhasil memetakan kompleks protein-ligan dengan afinitas tertinggi yang dapat menghambat protease utama (M pro ) dan glikoprotein spike (S) dari SARS-CoV-2 (Tallei et al, 2020). M pro dan S merupakan protein target yang sering digunakan dalam penelitian ativirus (Purwaniati & Asnawi, 2020). Domain makro adalah modul protein yang dimiliki oleh eukariot, bakteri dan arkea.…”

Section: Jika | 160unclassified

Molecular Docking Senyawa Potensial Anticovid-19 Secara in Silico

Perdana

Permana

2021

JIKA

View full text Add to dashboard Cite

Pandemi COVID-19 memacu peneliti menginvestigasi beberapa senyawa potensial yang dapat menghambat SARS-CoV-2. Tujuan dari penelitian ini adalah mengevaluasi senyawa menggunakan pendekatan molecular docking untuk menghambat domain makro SARS-CoV-2 (PDB: 7CZ4). Evaluasi dilakukan berdasarkan skor docking menggunakan AutoDock Vina. Konformasi terbaik dari kompleks reseptor ligan diindikasikan oleh afinitas tertinggi atau energi bebas Gibbs’/ΔG paling negatif. Hasil penelitian menunjukkan bahwa curcumin, rhamnetin, mycophenolic acid dan quercetin memiliki afinitas tertinggi. Selain itu, penelitian ini juga menunjukkan jumlah ikatan hidrogen dengan residu asam amino tertinggi sebagai indikator stabilitas secara berturut-turut: 4S0765P9W8, curcumin, rhamnetin dan mycophenolic acid. Hasil ini merupakan screening awal potensi senyawa tersebut sebagai anticovid-19 sehingga perlu dilengkapi dengan uji in vitro dan in vivo.

show abstract

Section: Jika | 160unclassified

Molecular Docking Senyawa Potensial Anticovid-19 Secara in Silico

Perdana

Permana

2021

JIKA

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

“…Lopinavir dan ritonavir dilaporkan senyawa obat yang memiliki aktivitas penghambatan main protease (Mpro). (Purwaniati & Asnawi, 2020).…”

Section: Pendahuluanunclassified

STUDI PENAMBATAN MOLEKULER SENYAWA FLAVONOID DAUN JAMBU BIJI (Psidium guajava L.) TERHADAP SARS-CoV-2 3CL PROTEASE

2021

View full text Add to dashboard Cite

Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) yang disebabkan oleh Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2) yang dimana COVID-19 ini telah menjadi wabah secara global. Beberapa penelitian yang dilakukan secara in-silico daun jambu biji (Psidium guajava L.) terbukti memiliki aktivitas dalam menghambat main protease/3CL Protease dari beberapa protein yang tersedia didalam protein data bank. Tujuan dari penelitian ini yaitu untuk mengetahui potensi senyawa flavonoid daun jambu biji (Psidium guajava L.) sebagai penghambat 3CL Protease pada protein dengan PDB ID : 6M2N menggunakan uji penambatan molekul. Pengujian dalam penelitian ini meliputi uji Lipinski, penambatan molekul, dan prediksi ADMET. Metode yang digunakan adalah penambatan molekul dengan program AutoDockTools 1.5.6. Hasil dari 31 senyawa yang telah melalui penambatan molekul beberapa senyawa uji diantaranya memiliki nilai penambatan molekuler dalam bentuk (energi ikat bebas (ΔG)) terbaik yaitu senyawa Epicatechin-3-O-Gallate dengan nilai -9,08 kcal/mol, glycitin dengan nilai -8,84 kcal/mol, dan ononin -8,51 kcal/mol. Epicatechin-3-O-Gallate dinilai memiliki potensi yang besar sebagai penghambat 3CL Protease karena memiliki kekuatan dan kestabilan ikatan yang tinggi saat ditambatkan pada protein target. Residu asam amino GLU 166, LEU 141, GLY 143 dan CYS 145 merupakan residu yang paling banyak berkontribusi dalam pembentukan ikatan hidrogen.

show abstract

“…[ 2 ] As work targets for this antiviral drug candidate, various structural and nonstructural proteins can be targeted. [ 3 4 ]…”

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

“…There are several designs and working mechanisms for the work goal of the COVID-19 antiviral drug that was used, namely, (a) it may inhibit the operation of virus functional proteins or enzymes such that the process of viral RNA synthesis and replication is inhibited; (b) may interact with the viral S protein, thereby blocking the binding between viruses and receptors of human cells; (c) to restore innate immunity to the host, virulence factors can be produced; and (d) It can interact with host specific enzymes or receptors to prevent viruses from entering the host cells. [ 3 ]…”

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

Working goal of Brazilein sappan wood as a candidate for SARS-coV-2 antivirus drug against spike (S) glycoprotein, papain-like proteinase, and main protease

Arundina

Budhy

Juliastuti

et al. 2021

Journal of Advanced Pharmaceutical Technology &Amp; Research

View full text Add to dashboard Cite

Brazilein sappan wood, played by Spike (S) glycoprotein, Papain-Like proteinase (PLpro), and Main protease (Mpro), is expected to be a candidate for the antiviral drug SARS-CoV-2, which can inhibit viral attachment to the human body, replication, and transcription processes. The aim of this study was to predict in silico, using the comparative drug hydroxychloroquine, the working goal of brazilein sappan wood as a candidate for the antiviral drug SARS-CoV-2 against protein S, PLpro, and Mpro. The approach used is the in silico docking test using the computer program Molegro Virtual Docker. Receptor used by protein S, Protein Data Bank (PDB) code: 6M0J, NAG_601[E] ligand; PLpro, PDB code: 7JIT, Y95_501[A] ligand; and Mpro, PDB code: 1WOF, I12_1145[A] ligand. Data analysis was carried out by comparing the docking bond energies between the ligands at the target receptor. Silico test results for protein S: ligand bond energy NAG_601 [E] = −59.4555, brazilein = −71.5537, hydroxychloroquine = −79.3704; PLpro protein: Ligand bond energy Y95_501 [A] = −129.561, brazilein = −94.9761, hydroxychloroquine = −100.984; Mpro protein: Ligand bond energy I12 1145 [A] = −141.135, brazilein = −96.6169, hydroxychloroquine = −104.88. The above test results indicate that brazilein sappan wood has potential as a SARS-CoV-2 drug candidate, has a stable bond, and that the biological activity of the compound is stronger against S protein than the proteins of PLpro and Mpro.

show abstract

Target Kerja Obat Covid-19: Review

Cited by 6 publications

References 14 publications

Molecular Docking Senyawa Potensial Anticovid-19 Secara in Silico

Molecular Docking Senyawa Potensial Anticovid-19 Secara in Silico

STUDI PENAMBATAN MOLEKULER SENYAWA FLAVONOID DAUN JAMBU BIJI (Psidium guajava L.) TERHADAP SARS-CoV-2 3CL PROTEASE

Working goal of Brazilein sappan wood as a candidate for SARS-coV-2 antivirus drug against spike (S) glycoprotein, papain-like proteinase, and main protease

Contact Info

Product

Resources

About