El presente texto persigue proponer una metodología de trabajo para la reintegración cromática de las lagunas presentes en 14 lienzos del fondo de la Facultad de Bellas Artes de la Universidad de Lisboa (FBAUL). Para el desarrollo de dicha metodología de intervención, se ha realizado un estudio de caracterización de las lagunas basado en aspectos como su profundidad en los estratos pictóricos, su localización y las propiedades de la película pictórica que las rodea. Además, se ha llevado a término un análisis cuantitativo de las lagunas mediante la aplicación de un programa informático gratuito de Sistemas de Información Geográfica (SIG) llamado QGIS®. Así, en base a los datos obtenidos mediante estos análisis y junto a cuestiones de ética sobre el tratamiento de las lagunas, se ha desarrollado una metodología de reintegración para los 14 lienzos, pudiendo servir como referencia para otros casos de características similares.