Objetivo: avaliar os aspectos motivacionais de um material educacional on line conhecido como Cybertutor contendo informações sobre síndromes genéticas para alunos do ensino fundamental.Métodos: participaram deste estudo 21 alunos do 9° ano do ensino fundamental do município de Bauru. Após 30 dias de acesso ao Cybertutor, utilizou-se a Ficha de Pesquisa Motivacional para avaliar os aspectos motivacionais desta ferramenta. A Ficha de Pesquisa Motivacional é composta por 32 enunciados agrupados em 4 domínios: estimulante, significativo, organizado e fácil de usar.Resultados: todos os participantes avaliaram positivamente o material educacional on line desenvolvido, considerando-o como “Impressionante”. O Teste de Friedman encontrou diferença estatística significante entre os domínios avaliados, com p=0,002239. A comparação individual entre os domínios demonstra resultados significantes na pontuação do domínio organizado.Conclusão: o Cybertutor sobre síndromes genéticas desenvolvido obteve alta satisfação motivacional. Dessa forma, conclui-se que este material educacional on line pode ser utilizado como uma estratégia de educação em saúde nesta temática.