Muitos corpos hídricos têm sido degradados devido à interferência humana. A poluição causada pelas atividades antrópicas vem comprometendo a qualidade da água e promovendo eventos de eutrofização, afetando toda estrutura trófica do ambiente, podendo assim acarretar na proliferação de cianobactérias tóxicas. Nesse sentido, o conhecimento sobre esses organismos é de grande importância, principalmente em corpos hídricos com usos múltiplos. Esta pesquisa representa uma revisão de trabalhos publicados envolvendo qualidade ambiental e ecolotoxicologia aquática, tendo como foco estudos relacionados às cianobactérias e cianotoxinas. Para o trabalho foram analisados livros textos e artigos publicados entre 2010 e 2020 em periódicos nacionais e internacionais. Na literatura publicada nos últimos anos são apresentadas as principais metodologias envolvidas na detecção e remoção de cianotoxinas, além de bioensaios ecotoxicológicos. Fica evidente a importância do tratamento de efluentes e controle das fontes de poluição difusas e pontuais no ecossistema promovendo a melhoria da qualidade da água e controle de cianobactérias.ABSTRACTCyanobacteria play an important role among producers in aquatic ecosystems, however when associated with eutrophication they become an ecological and public health problem. The problem involving cyanobacteria is the blooming of potentially toxic strains. The present work aims to present and discuss the problems related to the proliferation of cyanobacteria in limnological environments, and its consequences for dynamics in the environment and effects on environmental health. In this sense, knowledge about these organisms is of great importance, especially in water bodies with multiple uses. This research represents a review of published works involving environmental quality and aquatic ecotoxicology, focusing on studies related to cyanobacteria and cyanotoxins. For the present work, textbooks and articles published between 2010 and 2020 in national and internationaljournals were analyzed. In the literature published in recent years, the main methodologies involved in the detection and removal of cyanotoxins are presented, in addition to ecotoxicological bioassays. The study of cyanobacteria and their metabolites comprises an area of interest that reaches a greater dimension when impacts on the quality of water supply are evident, thus the importance of treating effluents and controlling pollution sources in the ecosystem is evident, promoting improvement and maintenance the quality of the water bodies.