The functional role of long non-coding RNAs and epigenetics

Abstract

Long non-coding RNAs (lncRNAs) are non-protein coding transcripts longer than 200 nucleotides. The post-transcriptional regulation is influenced by these lncRNAs by interfering with the microRNA pathways, involving in diverse cellular processes. The regulation of gene expression by lncRNAs at the epigenetic level, transcriptional and post-transcriptional level have been well known and widely studied. Recent recognition that lncRNAs make effects in many biological and pathological processes such as stem cell pluripotency, neurogenesis, oncogenesis and etc. This review will focus on the functional roles of lncRNAs in epigenetics and related research progress will be summarized.

Upregulation and Clinicopathological Significance of Long Non-coding NEAT1 RNA in NSCLC Tissues

“…Moreover, functional analyses have revealed that lncRNAs play essential roles in a range of developmental processes , SuNing Huang 1 , Gang Chen 2 * and diseases, including tumorigenesis and metastasis (Gupta et al, 2010;Cao, 2014;Liu et al, 2014). Aberrantly expressed lncRNAs are a hallmark of carcinomas, suggesting their potential application as predictive and prognostic biomarkers (Li et al, 2014;Liu et al, 2014).…”

Epigenetic modifications and gene expression in cancerogenesis

“…Należy podkreślić ich znaczenie w modyfikacji chromatyny, transkrypcji, procesach potranskrypcyjnych oraz rozwoju nowotworów. Prowadzone badania dostarczają informacji odnośnie do możliwości wykorzystania ncRNA w terapii, jako potencjalnych biomarkerów w diagnostyce chorób o podłożu nowotworowym [35,36,37].…”

“…HOTAIR (HOX antisense intergenic RNA) w raku piersi, wątroby, trzustki, PCGEM1 (Prostate Specific Gene 1), DD3 (Differential Display Code 3), PCNCR1 (Prostate Cancer Non-Coding RNA 1) w raku prostaty [35,37]. Fenotypowo-specyficzna ekspresja lncRNA oraz ich stopień zaangażowania w proces nowotworzenia sprawiają, że czą-steczki te są idealnymi kandydatami na biomarkery w diagnostyce i terapii nowotworów.…”

“…Metylacja DNA powoduje zmniejszenie lub całkowite wyciszenie ekspresji supresorowych lncRNA guza, a w konsekwencji może prowadzić do pozytywnej regulacji onkogenów. Za-stosowanie inhibitorów metylacji DNA -5-aza-2'-deoksycytydyny, pozwala na włączenie ekspresji hipermetylowanych lncRNA, która z kolei może zostać wzmocniona w wyniku działania kwasu 4-fenylomasłowego lub trichostatyny, należących do inhibitorów deacetylazy histonów -HDAC [37].…”

Long Non-Coding RNAs; New Perspective for Autoimmune Disease

“…There are different categories in separation of transcriptome, the common categories separate RNAs based on size [5]. Long non-coding RNAs (lncRNAs) are the class of transcriptome, with size larger than 200 nucleotides [6]. The about lncRNAs which are involved in multiple sclerosis (MS).…”