The reasons why Klebsiella pneumoniae becomes a leading opportunistic pathogen

Chebotar, I. V.; Bocharova, Yu.A.; Podoprigora, I. V.; Shagin, Dmitry A.

doi:10.36488/cmac.2020.1.4-19

Cited by 15 publications

(4 citation statements)

References 168 publications

Supporting

Mentioning

Contrasting

Unclassified

Order By: Relevance

“…K. pneumoniae способна служить причиной целого ряда тяжелых инфекций у пациентов с ослабленным иммунитетом, страдающих сахарным диабетом, злокачественными новообразованиями, алкогольной зависимостью, а также у лиц, подвергающихся медицинскому вмешательству, как правило, развивающихся в условиях стационара. От 3% до 9% всех вспышек внутрибольничных инфекций обусловлены K. pneumoniae [1,2]. Спектр заболеваний, причиной которых является K. pneumoniae, включает пневмонию, инфекции мочевыводящих путей, брюшной полости, мягких тканей, сопровождающиеся бактериемией и развитием сепсиса [3].…”

Section:  введениеunclassified

“…Предложен фенотипический тест («струнный тест»), позволяющий при использовании инокуляционной петли растянуть колонию бактерии как минимум на пять миллиметров и тем самым определить наличие гипермукоида. Данный тест используется для дифференциации классических (cKp) и гипервирулентных (hvKp) штаммов [1,4,8]. Однако установлено, что не все штаммы hvKp являются гипермукоидными, кроме того, некоторые штаммы cKp также обладают этой характеристикой.…”

Section:  введениеunclassified

See 1 more Smart Citation

Analysis of Klebsiella Pneumoniae Isolates with Extremely High Antibiotic Resistance

Егоров¹,

Семёнов²,

Дмитраченко³

2022

Педиатрия. Восточная Европа

View full text Add to dashboard Cite

Введение. Klebsiella pneumoniae – хорошо известный, традиционно считающийся условно-патогенным микроорганизм. K. pneumoniae способна служить причиной целого ряда тяжелых инфекций у пациентов с ослабленным иммунитетом, страдающих сахарным диабетом, злокачественными новообразованиями, алкогольной зависимостью, а также у лиц, подвергающихся медицинскому вмешательству, как правило, развивающихся в условиях стационара.Цель. Определение генетических характеристик и детерминант антибиотикорезистентности (генов, мутаций, однонуклеотидных полиморфизмов), обуславливающих широкую резистентность к антибиотикам изолятов K. Pneumoniae, выделенных от пациентов реанимационных отделений.Материалы и методы. Выполнено полногеномное секвенирование найденных изолятов с широкой резистентностью к антибиотикам. Проведен генетический анализ нуклеотидных последовательностей.Результаты. Определены сиквенс-типы, капсульные типы, локусы поверхностных полисахаридов исследуемых изолятов Klebsiella pneumoniae. Найдены гены и плазмиды, способные детерминировать резистентность к антибиотикам.Выводы. Результаты указывают на циркуляцию гипервирулентных штаммов Klebsiella pneumoniae в Республике Беларусь, что затрудняет клиническую диагностику и может сопровождаться неэффективностью проведения стандартной антибактериальной терапии у пациентов различного возраста, что имеет особое значение для отделений интенсивной терапии и отделений патологии новорожденных. Introduction. Klebsiella pneumoniae is a well-known pathogen which is considered opportunistic. It can cause a severe infection in immunocompromised patients with diabetes mellitus, malignant neoplasms, alcohol dependence, as well as in individuals undergoing medical intervention, usually in hospital conditions.Purpose. To establish genetic characteristics and determinants of drug- resistance to antibiotics (genes, mutations, single-nucleotide polymorphisms) responsible for extensive antibiotic resistance of K. Pneumoniae isolates from intensive care unit patients.Materials and methods. Full-genome sequencing and genetic analysis of the primary nucleotide sequences was performed.Results. Sequence types, capsule types, and surface polysaccharide loci of Klebsiella pneumoniae isolates were determined. Genes and plasmids capable of determining resistance to antibiotics were found and characterized.Conclusions. The results indicate the presence of hypervirulent strains of Klebsiella pneumoniae, which complicates diagnosing and may be accompanied by the ineffectiveness of standard antibiotic therapy in patients of different ages, being of particular importance for intensive care units and neonatal pathology departments.

show abstract

Section:  введениеunclassified

Analysis of Klebsiella Pneumoniae Isolates with Extremely High Antibiotic Resistance

Егоров¹,

Семёнов²,

Дмитраченко³

2022

Педиатрия. Восточная Европа

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

“…Лидерство K. pneumoniae среди других оппортунистических возбудителей связано не столько с усилением вирулентных свойств бактерии, сколько с ее способностью быстро формировать резистентность к разным антибактериальным лекарственным средствам (ЛС). Адаптивная (приобретенная) резистентность обусловлена собственно мутациями в геноме или же горизонтальным переносом генетического материала от «резистентного микробного окружения», что может приводить к невосприимчивости практически ко всем классам антибиотиков [1]. Устойчивость K. рneumoniae реализуется разными механизмами: модификацией и экранированием мишеней, нарушением проницаемости наружной мембраны, эффлюксом антибиотика.…”

Section: Introductionunclassified

“…Важное клиническое и эпидемиологическое значение имеет гидролиз бета-лактамазами бета-лактамных антибиотиков, в том числе и карбапенемов. У K. pneumoniae была выявлена продукция бета-лактамаз всех четырех известных классов, но наиболее значимая -продукция карбапенемаз -ферментов молекулярных классов A (KPC), B (VIM, NDM, IMP), D (OXA-48) [1,2,3].…”

Section: Introductionunclassified

Analysis of Antibiotic Resistance of K. Pneumoniae Strains Isolated in a Multidisciplinary Hospital

Antonova¹,

Zhyltsou²

2021

Journal GrSMU

View full text Add to dashboard Cite

Background. The prevalence of infections caused by multiple resistant K. pneumoniae strains is an actual problem. Purpose. To investigate antibacterial resistance of hospital strains of K. pneumoniae – causative agents of purulent septic infections, to determine the resistance level of carbapenem-resistant strains of K. pneumoniae to polymyxins, to analyze their main profiles of antibiotic sensitivity. Material and methods. Antibiotic susceptibility of 146 clinical isolates of K. pneumoniae was determined using the disk diffusion method. The method of sequential microdilutions in broth with determination of MIC was used for isolates resistant to carbapenems. Results. For the majority of clinical isolates of K. pneumoniae (85.2%), only 3 antibiotics (colistin, tigecycline and amikacin) showed acceptable activity in vitro. For one strain resistance to all tested antimicrobial drugs was revealed. Conclusion. The data on extremely high resistance of K. pneumoniae to carbapenems, fluoroquinolones and aminoglycosides were confirmed. A high level of colistin resistance was also identified.

show abstract

Genomic analysis of <i>Klebsiella pneumoniae</i> strains virulence and antibiotic resistance

Samoilova,

Kraeva,

Mikhailov

et al. 2024

Russian Journal of Infection and Immunity

View full text Add to dashboard Cite

Recently, Klebsiella pneumoniae strains have become widespread both in community-acquired infectious processes and in nosocomial infections. There are two pathotypes of K. pneumoniae: classical (cKp) and hypervirulent (hvKp). Representatives of any pathotype are prone to acquire and further transmit genetic factors of antibiotic resistance and virulence. This combination accounts for severity of the infectious process. Therefore, information about whether the strain belongs to either pathotype can help in prescribing proper therapy. Since there is no consensus upon hypervirulence marker, we attempted to find the most significant combinations of genetic markers of virulence and antibiotic resistance in K. pneumoniae strains. The study was aimed to conduct a genomic analysis of virulence and antibiotic resistance of K. pneumoniae clinical isolates. Materials and methods. There were examined 85 strains of K. pneumoniae isolated from diverse clinical material samples from patients in large St. Petersburg hospitals. In our work, we used classical bacteriological methods, including determination of the hypermucoviscous type using the “string test”, the mass spectrometric method (MALDI-ToF MS) for identifying bacteria, molecular methods for studying markers of virulence and antibiotic resistance (multilocus sequence typing, genome sequencing of K. pneumoniae strains). Results. Among the studied K. pneumoniae strains, the most common carbapenemase genes were OXA-48 (18.7%) and NDM-1 genes — 17.3% of strains; in 6.7% of strains, NDM-1 and OXA-48 genes were found simultaneously. The percentage of strains with β-lactamase genes CTX-M-15 was 54.7%, OXA-1 — 17.3%, TEM-1D — 13.3%, and in 17.3% of cases the OXA-1 and TEM-1D genes were simultaneously present in bacterial strains. Quinolone resistance genes were found in 68.4% of strains. The most common genes were qnrS1 (40% of strains) and qnrB1 (22.7%). Phenotypic antimicrobial susceptibility testing showed that 23.5% and 64.7% strains were resistant to colistin and carbapenems, respectively. 32.9% K. pneumoniae strains, isolated in patients with phlegmon, pneumonia, sepsis, and peritonitis, had a hypermucoid phenotype. The most common sequence types were: ST395 (24.3%), ST23 (17.6%) and ST512 (9.5%). 8% and 25.3% of strains belonged to capsule types K1 and K2, respectively. The polyketide synthesis locus ybt, which characterizes virulent strains, was detected in 69.3% isolates, and the clb locus was present in 10.7% of strains. In 73.3% and 14.7% strains, the plasmid-associated virulence loci iuc and iro were identified, which encode the biosynthesis of the siderophores aerobactin and salmochelin. We described 44 cases (58.7% of strains) of genotypic convergence of virulence and antibiotic resistance, as shown by simultaneously detected the aerobactin (iuc) locus and β-lactamase or carbapenemase genes. Thus, identification of hypervirulence may provide valuable information for the clinical management of patients with hvKp infections. Therefore, it is is obviously necessary to develop comprehensive diagnostic test for simultaneous screening of multidrug-resistant hypervirulent K. pneumoniae strains.

show abstract

The reasons why Klebsiella pneumoniae becomes a leading opportunistic pathogen

Cited by 15 publications

References 168 publications

Analysis of Klebsiella Pneumoniae Isolates with Extremely High Antibiotic Resistance

Analysis of Klebsiella Pneumoniae Isolates with Extremely High Antibiotic Resistance

Analysis of Antibiotic Resistance of K. Pneumoniae Strains Isolated in a Multidisciplinary Hospital

Genomic analysis of <i>Klebsiella pneumoniae</i> strains virulence and antibiotic resistance

Contact Info

Product

Resources

About