The role of allelopathy in host-virus relations

Kazinczi, G.; Horváth, J; Takács, A.; Béres, I.; Gáborjányi, R.; Nádasy, M.

doi:10.1556/crc.33.2005.1.25

Cited by 6 publications

(6 citation statements)

References 6 publications

Supporting

Mentioning

Contrasting

Unclassified

Order By: Relevance

“…However, Esprit gave the highest fresh weight and dry weight as compared the other cultivars. Other findings on sorghum [50], chickweed [51], E. makinoi [52], cucurbit [53], sugar beet [54], and S. nigrum [55] support our findings. In pepper, Tobacco mosaic virus (TMV) infection caused reduction in shoot fresh and dry weight [48].…”

Section: Morphological and Physiological Indices Among Cultivars Unde...supporting

confidence: 91%

Genotyping-by-sequencing and weighted gene co-expression network analysis of genes responsive against Potato virus Y in commercial potato cultivars

Hajibarat,

Saidi,

Zeinalabedini

et al. 2024

PLoS ONE

View full text Add to dashboard Cite

Potato is considered a key component of the global food system and plays a vital role in strengthening world food security. A major constraint to potato production worldwide is the Potato Virus Y (PVY), belonging to the genus Potyvirus in the family of Potyviridae. Selective breeding of potato with resistance to PVY pathogens remains the best method to limit the impact of viral infections. Understanding the genetic diversity and population structure of potato germplasm is important for breeders to improve new cultivars for the sustainable use of genetic materials in potato breeding to PVY pathogens. While, genetic diversity improvement in modern potato breeding is facing increasingly narrow genetic basis and the decline of the genetic diversity. In this research, we performed genotyping-by-sequencing (GBS)-based diversity analysis on 10 commercial potato cultivars and weighted gene co-expression network analysis (WGCNA) to identify candidate genes related to PVY-resistance. WGCNA is a system biology technique that uses the WGCNA R software package to describe the correlation patterns between genes in multiple samples. In terms of consumption, these cultivars are a high rate among Iranian people. Using population structure analysis, the 10 cultivars were clustered into three groups based on the 118343 single nucleotide polymorphisms (SNPs) generated by GBS. Read depth ranged between 5 and 18. The average data size and Q30 of the reads were 145.98 Mb and 93.63%, respectively. Based on the WGCNA and gene expression analysis, the StDUF538, StGTF3C5, and StTMEM161A genes were associated with PVY resistance in the potato genome. Further, these three hub genes were significantly involved in defense mechanism where the StTMEM161A was involved in the regulation of alkalization apoplast, the StDUF538 was activated in the chloroplast degradation program, and the StGTF3C5 regulated the proteins increase related to defense in the PVY infected cells. In addition, in the genetic improvement programs, these hub genes can be used as genetic markers for screening commercial cultivars for PVY resistance. Our survey demonstrated that the combination of GBS-based genetic diversity germplasm analysis and WGCNA can assist breeders to select cultivars resistant to PVY as well as help design proper crossing schemes in potato breeding.

show abstract

Section: Morphological and Physiological Indices Among Cultivars Unde...supporting

confidence: 91%

Genotyping-by-sequencing and weighted gene co-expression network analysis of genes responsive against Potato virus Y in commercial potato cultivars

Hajibarat,

Saidi,

Zeinalabedini

et al. 2024

PLoS ONE

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

“…Much has been reported already about viruses of plants, humans and animals so this will only be discussed briefly as antagonistic components of the micro-ecostystem. Kazinczi et al (2004) pointed out that weeds, as alternative hosts of plant viruses can act as alternative nutrient sources for viruses and virus vectors. Weeds play important role in virus ecology and epidemiology.…”

Section: Plant-fungi-mycovirus Interac-tionsmentioning

confidence: 99%

Mycoviruses: trends in plant-fungus-mycovirus interactions and ‘biocontrol’ prospects in agriculture and the environment

NDIFON,

CHOFONG

2023

aas

View full text Add to dashboard Cite

Mycoviruses are cosmopolitan in plants, animals, fungi, bacteria, in soils, and water. There is a scarcity of information about them, which necessitated this review to provide some leads on where research should focus. Mycoviruses are able to persist in disparate types of hosts by utilizing diverse measures. They may engage either parasitic, pathogenic, or mutualistic tendencies. Mycoviruses employ many existential strategies that can be utilized by man. Hypovirulence may be induced in fungal hosts by mycoviruses via RNA silencing, alteration of genetic expression, and disruption of the transcriptome. Mycoviruses interact with killer phenotypes of yeasts and Ustilago spp. and proffer advantages to these fungi. Mycovirus interaction with some plants result in provision of thermal tolerance to plants. Based on their mode of microbe destruction mycoviruses may be used for waste disposal and termination of some life processes. For instance, grazer viruses completely oxidize the organic content of their host into carbon dioxide and inorganic nutrients, while lytic viruses release the organic material from their hosts without modification. Viruses may be utilized to facilitate the exchange of genetic material from one host to another. However, pathogenic mycoviruses exist especially in mushrooms.

show abstract

“…Co więcej, wyniki z ostatnich lat wskazują na zmiany w obrębie interakcji wirusroślina, o czym świadczy pozyskiwanie przez PVY nowych gospodarzy, np. wśród gatunków roślin dziko żyjących (Chatzivassiliou i in., 2004;Fletcher, 2001;Kazinczi i in., 2004). Chwasty mogą pełnić rolę alternatywnych gospodarzy wirusa, stając się (zwłaszcza chwasty wieloletnie) naturalnym jego rezerwuarem i źródłem infekcji pierwotnej (Alvarez i in., 2007).…”

Section: Wstępunclassified

Przenoszenie różnych genetycznie izolatów wirusa Y ziemniaka przez mszyce i podatność chwastów na infekcję wirusem

Kaliciak,

Syller

2009

Biuletyn IHAR

View full text Add to dashboard Cite

Wirus Y ziemniaka (PVY) jest ważnym gospodarczo patogenem atakującym uprawy ziemniaka, tytoniu i papryki. Wirus przenoszony jest w sposób nietrwały przez mszyce, głównie przez Myzus persicae. Do efektywnego przeniesienia wirusa z rośliny chorej na zdrową wystarcza krótki (< 1 min.) czas żerowania owada na roślinie. Od ponad 20 lat stwierdza się szybkie rozprzestrzenianie nowych, bardziej infekcyjnych wariantów PVY, najczęściej klasyfikowanych w podgrupach PVYNTN i PVYNW szczepu PVYN. Dynamiczne szerzenie się nowych wariantów genetycznych PVY może wskazywać, że efektywnie współdziałają one z wektorami wirusa. W prowadzonych w Młochowie badaniach nad przenoszeniem przez M. persicae 12 izolatów PVY na rośliny Nicotiana tabacum, Physalis floridana i Solanum nigrum zastosowano krótki i długi czas żeru nabycia wirusa na roślinach stanowiących źródła wirusa. Wykazano, że izolaty PVYNTN i PVYNW były przenoszone istotnie efektywniej, niż znane od dawna, standardowe izolaty PVYN i PVY0. Stwierdzono ponadto, że mszyce nadspodziewanie efektywnie przenosiły niektóre izolaty po długotrwałym (3 dni) żerowaniu na roślinach źródłowych. Stopień porażenia inokulowanych roślin zależał także od ich gatunku. Zróżnicowanie genetyczne w obrębie populacji PVY nie może pozostawać bez wpływu na zdolność współdziałania wirusa z roślinami-gospodarzami, a w konsekwencji na zakres gospodarzy wirusa. Gospodarzami PVY, oprócz roślin uprawnych, są niektóre gatunki roślin dziko żyjących. Porażone chwasty mogą pełnić rolę naturalnego rezerwuaru wirusa i stanowić źródło infekcji pierwotnej. Zidentyfikowano trzech nowych, naturalnych gospodarzy PVY wśród chwastów powszechnie występujących w Polsce. Są to: bodziszek drobny i iglica pospolita (Bodziszkowate) oraz jasnota purpurowa (Jasnotowate). Potwierdzono ponadto wcześniejsze doniesienie z Grecji, że gospodarzem PVY jest sałata kompasowa (Astrowate), chwast popularny również w warunkach naszego kraju.

show abstract

The role of allelopathy in host-virus relations

Cited by 6 publications

References 6 publications

Genotyping-by-sequencing and weighted gene co-expression network analysis of genes responsive against Potato virus Y in commercial potato cultivars

Genotyping-by-sequencing and weighted gene co-expression network analysis of genes responsive against Potato virus Y in commercial potato cultivars

Mycoviruses: trends in plant-fungus-mycovirus interactions and ‘biocontrol’ prospects in agriculture and the environment

Przenoszenie różnych genetycznie izolatów wirusa Y ziemniaka przez mszyce i podatność chwastów na infekcję wirusem

Contact Info

Product

Resources

About