O artigo tem como objetivo a análise das anomalias congênitas causadas por vírus, com enfoque específico para os vírus da Zika (Zikavirus), da rubéola (Rubivirus), para o HIV (Vírus da Imunodeficiênia Humana) e para o citomegalovírus. O método utilizado foi uma revisão qualitativa de artigos científicos, realizada por meio de uma busca eletrônica na base de dados do Pubmed e Scielo por: índice, título, combinações das palavras-chave em língua inglesa, tais como “malformations, virus, congenital malformation, prevalence and incidence, zikavirus, cytomegalovirus”. Os resultados demonstram a prevalência desses quatro agentes infecciosos na gênese das principais malformações congênitas conhecidas atualmente. Conclui-se, portanto, a necessidade de conhecer a fundo tais doenças e suas manifestações para, respaldando-se em tais conhecimentos, efetivar as condutas médicas corretas.