The use of saliva specimens for detection of influenza A and B viruses by rapid influenza diagnostic tests

Yoon, Jung Hee; Yun, Seung Gyu; Nam, Jeonghun; Choi, Sung Hyuk; Lim, Chae Seung

doi:10.1016/j.jviromet.2017.01.013

Cited by 38 publications

(39 citation statements)

References 15 publications

Supporting

Mentioning

Contrasting

Unclassified

Order By: Relevance

“…The overall sensitivity rates for the detection of influenza A and B for the DIAs STANDARD F (71.7%) and Sofia (70.6%) were significantly higher than the traditional RIDT SD Bioline (55.8%) and conventional IF/culture (52.8%). The higher sensitivity rate of the DIAs compared with SD Bioline are similar to previous report . The sensitivity rates for the SD Bioline assay are similar to summary sensitivities for traditional RIDTs, which utilizes the immunochromatographic technique, of 54.4% for influenza A and 53.2% for influenza B .…”

Section: Characteristics Of Enrolled Patients and Types Of Sample In supporting

confidence: 88%

Evaluation of rapid influenza diagnostic tests for influenza A and B in the tropics

Chong

Tan

Hooi

et al. 2019

Journal of Medical Virology

View full text Add to dashboard Cite

Rapid diagnosis of influenza is important for early treatment and institution of control measures. In developing tropical countries such as Malaysia, influenza occurs all year round, but molecular assays and conventional techniques (such as immunofluorescence and culture) for diagnosis are not widely available. Rapid influenza diagnostic tests (RIDTs) may be useful in this setting. A total of 552 fresh respiratory specimens were assessed from patients with respiratory symptoms at a teaching hospital in Kuala Lumpur, Malaysia from November 2017 to March 2018. Two digital immunoassays (DIAs), STANDARD F Influenza A/B Fluorescence Immunoassay (STANDARD F) and Sofia Influenza A + B Fluorescence Immunoassay (Sofia) and one conventional RIDT (immunochromatographic assay), SD Bioline Influenza Ag A/ B/A(H1N1) Pandemic rapid test kit (SD Bioline) were evaluated in comparison with a WHO-recommended reverse transcription quantitative PCR (RT-qPCR). Of the 552

show abstract

Section: Characteristics Of Enrolled Patients and Types Of Sample In supporting

confidence: 88%

Evaluation of rapid influenza diagnostic tests for influenza A and B in the tropics

Chong

Tan

Hooi

et al. 2019

Journal of Medical Virology

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

“…Описана ампліфікація будь-яких можливих підтипів ВГА за допомогою універсальної праймерної системи з послідуючим секвенуванням [16]. Донедоліків методів, основаних на секвенуванні, відноситьсяїх трудомісткість, кошторисність, необхідність кошторисного обладнання (наприклад, автоматичний секвенатор), а також значні витрати часу та реагентів на додаткову очистку продуктів ампліфікації перед проведенням секвенування [17]. Методи ПЛР с детекцією в режимі реального часу використовуються як для типування вірусу грипу А, так і для визначення мутацій, що призводять до лікарської стійкості штаму H1N1 [18].…”

Section: пдрф аналіз та електрофореграма до рестриктазunclassified

Development of anexpress-method for influence and genotyping of H1N1 and H7N9 virus avian influenza a strains by PCR-RFLP analysis

Buriachenko¹,

Stegniy²

2019

ScienceRise: Biological Science

View full text Add to dashboard Cite

Епізоотичний моніторинг останніх років свідчить про те, що високопатогенний вірус грипу А птахів (H1N1) та (H7N9) активно циркулює на території Євразійських держав. За 2016-2019 рр. було зафік-совано1,6 тис. випадків спалахів. З них у Європі 872 випадки. Питання моніторингу за інфікованою як перелітною так і свійською птицею в місцях перехресного контакту в Україні є актуальним для запобігання виникнення спалахів епізоотії. Мета дослідження. Розробити експрес-метод ідентифікації та визначення вірусу пташиного грипу А Н1N1 та Н7N9 штамів на основі полімеразної ланцюгової реакції з аналізом поліморфізму довжин рестрикційних фрагментів (ПЛР-ПДРФ) РНК вірусу. Результати та обговорення. Проведений аналіз in silico ампліконів генів HA, NA та NP дозволив in silico розрахувати праймери до варіабельних локусів досліджуваних генів, розрахувати умови проведення реакції, визначити сайти рестрикції до добраних рестриктаз отримати теоретичні електрофореграми ПЛР-ПДРФ аналізу. Розроблено методику експрес-методу для виявлення та ідентифікації вірусу грипу А H1N1 та H7N9 за трьома генами (HA, NA та NP) РНК H1N1 та H7N9 у полімеразній ланцюговій реакції ПЛР суміщеній з ПДРФ аналізом. Метод експрес-діагностики здатний виявляти вірус пташиного грипу А H1N1 та H7N9 і диференціювати його від зразків інших збудників вірусних інфекцій птахів і тварин. Висновки. Розроблений метод експрес-ідентифікації на основі ПЛР суміщений з ПДРФ аналізом дає можливість значно спростити метод ідентифікації за рахунок специфічної ампліфікації ділянки РНК, що має поліморфний сайт рестрикції. Тестування стану цього локуса можливе шляхом попереднього проведення ПЛР та рестрикції ампліфікованого фрагменту. Встановлено, що метод експрес-діагностики ПЛР-ПДРФ здатний виявляти РНК вірус грипу А високопатогенних штамів H1N1 та H7N9 з високими показниками чутливості (100 % чутливість) Ключові слова: високопатогенний вірус пташиного грипу А H1N1, H7N9, експрес-метод діагностики ПЛР-ПДРФ, консервативні мотиви, варіабельні локуси, поліморфізм

show abstract

“…The poor sensitivity of the Alere i test for detection of influenza A virus was likely due to a study set that further diluted in VTM and went through multiple freeze and thaw cycles [27,29]. Studies using different off-label specimen types such as throat swabs (TS) and saliva have been reported [37,38]. [25,27,34,35].…”

Section: Several Clinical Evaluation Studies On the Alere I Influenzamentioning

confidence: 99%

Profile of the Alere i Influenza A & B assay: a pioneering molecular point-of-care test

Wang

Deng

Tang

2018

Expert Review of Molecular Diagnostics

View full text Add to dashboard Cite

The Alere i Influenza A & B assay incorporates the Nicking Enzyme Amplification Reaction technique on the Alere i instrument to detect and differentiate influenza virus (Flu) A and B nucleic acids in specific specimens. Areas covered: The Alere i Influenza A & B assay was cleared by the US Food and Drug Administration for use with nasal swabs (NS) and nasopharyngeal swabs, either directly or in viral transport medium. Notably, direct use on NS was the first ever CLIA-waived nucleic acid-based test. Previously published evaluations have reported sensitivities and specificities of 55.2-100% and 62.5-100% for Flu A and 45.2-100% and 53.6-100% for Flu B, respectively. Expert commentary: The Alere i Influenza A & B assay provides a rapid and simple platform for detection and differentiation of Flu A and B. Efforts are expected to further improve sensitivity and user-friendliness for effective and widespread use in the true point-of-care setting.

show abstract

The use of saliva specimens for detection of influenza A and B viruses by rapid influenza diagnostic tests

Cited by 38 publications

References 15 publications

Evaluation of rapid influenza diagnostic tests for influenza A and B in the tropics

Evaluation of rapid influenza diagnostic tests for influenza A and B in the tropics

Development of anexpress-method for influence and genotyping of H1N1 and H7N9 virus avian influenza a strains by PCR-RFLP analysis

Profile of the Alere i Influenza A & B assay: a pioneering molecular point-of-care test

Contact Info

Product

Resources

About