Tissue Typing by Means of PCR and Capillary Electrophoresis: New Aspects, Reality and Issues

Abstract

ООО «Ниармедик плюс», Москва Аннотация: Целью текущего обзора является раскрытие новых перспектив для РНК-и ДНК-анализа в ру-тинной практике судебной биологии. В обзоре рассмотрены современные тканевые маркеры, основанные на матричных РНК (мРНК), методы их тестирования и подходы для совмещения РНК-анализа со стандартными протоколами исследования судебного материала. Исходя из практического опыта зарубежных исследователей, новые маркеры вполне совместимы с класси-ческими протоколами, включая использование методов ПЦР и капиллярного электрофореза, и могут быть применены после постановки иммунологических тестов, что усиливает чувствительность и не требует прин-ципиального отказа от их использования. На сегодняшний день сформированы относительно готовые мультиплексные тканевые наборы, подготовлен-ные для коммерческих реализаций в скором будущем. Популяционное генетическое разнообразие в экспрес-сии генов определяет возможность разработки отечественных панелей мРНК-маркеров на базе существующих зарубежных панелей. Ключевые слова: типирование тканей, тканевые мРНК-маркеры TISSUE TYPING BY MEANS OF PCR AND CAPILLARY ELECTROPHORESIS: NEW ASPECTS, REALITY AND ISSUESBavykin A.S. Abstract: «When the DNA is not enough» -an issue that becoming popular among forensic biologists [1]. The reasons for that are methods of tissue typing, that have limited accuracy and gradually becoming obsolete. The purpose of this review is to discuss the integration of new mRNA markers to the routine genetic forensic practice. The review discusses possibilities of utilizing the developed mRNA biomarkers for tissue typing as well as the approaches of combining gene expression analyses with standard sample workflow in forensic and criminal laboratories. Based on data obtained by the foreign researches, new mRNA markers are quite compatible with classical protocols, including PCR and capillary electrophoresis, increase the specificity of immunological methods and do not require rejection of their use. In the near future we can expect commercially developed tissue specific and multiplex assays at markets abroad. Although population diversity of genetic expression does not allow to create a universal multiplex panel, nevertheless the existing tissue mRNA panel can be enriched by the national features.