Tumor Necrosis Factor-α G-308A Polymorphism and Sporadic IgA Nephropathy: A Meta-Analysis Using a Genetic Model-Free Approach

Tziastoudi, Maria; Chronopoulou, Ioanna; Pissas, Georgios; Cholevas, Christos; Eleftheriadis, Theodoros; Stefanidis, Ioannis

doi:10.3390/genes14071488

Cited by 3 publications

(1 citation statement)

References 58 publications

Supporting

Mentioning

Contrasting

Order By: Relevance

“…Furthermore, it eliminates the need for a predetermined selection of a specific genetic model. It is worth noting that this metric has been successfully applied in diverse research contexts, including studies related to conditions like diabetic nephropathy, IgAN, and chronic kidney disease [46][47][48][49][50][51][52].…”

Section: Discussionmentioning

confidence: 99%

Interleukin Variants Are Associated with the Development and Progression of IgA Nephropathy: A Candidate-Gene Association Study and Meta-Analysis

Chronopoulou,

Tziastoudi,

Pissas

et al. 2023

IJMS

Self Cite

View full text Add to dashboard Cite

The interleukin-1 gene cluster encodes cytokines, which modulate mesangial cell proliferation and matrix expansion, both constituting central factors in the development and progression of immunoglobulin A nephropathy (IgAN). A candidate-gene study was performed to examine the association of polymorphisms of the interleukin-1 gene cluster with the risk of progressive IgAN. To gain deeper insights into the involvement of interleukin genes in IgAN, a meta-analysis of genetic association studies (GAS) that examine the association between interleukin variants and IgAN was conducted. Association study: The case-control study consisted of 121 unrelated Caucasians with sporadic, histologically diagnosed IgAN and of 246 age- and sex-matched healthy controls. Persistent proteinuria (>2 g/24 h) and/or impaired kidney function (serum creatinine > 1.5 mg/dL) defined progressive (n = 67) vs. non-progressive (n = 54) IgAN cases. Genotypes were assessed for two promoter-region single-nucleotide polymorphisms, C-899T (rs1800587) in IL1A and C-511T (rs16944) in IL1B, and for one penta-allelic variable-length tandem repeat polymorphism (VNTR 86 bp intron 2) in IL1RN. The association of these variants with the susceptibility of IgAN and the development of progressive IgAN (healthy status, IgAN, progressive IgAN) was tested using the generalized odds ratio (ORG) metric. Linkage disequilibrium and haplotype analysis were also performed. Meta-analysis: We included in the meta-analysis 15 studies investigating association between 14 interleukin variants harbored in eight different genes and IgAN. The ORG was used to evaluate the association between interleukin variants and IgAN using random effects models. The present case-control study revealed association of IL1B C-511T (rs16944) with the progression of IgAN (p = 0.041; ORG = 2.11 (1.09–4.07)). On haplotype analysis, significant results were derived for the haplotypes C-C-1 (p = 0.005; OR = 0.456 (0.261~0.797)) and C-T-2 (p = 0.003; OR = 4.208 (1.545–11.50)). Regarding association and meta-analysis results, variants in IL1B (rs1143627 and rs16944), IL1RN (rs928940, rs439154, and rs315951) and IL10 (rs1800871) were associated with IgAN based on either genotype or allele counts. Genetic variants and haplotypes in the IL1B, IL1RN, and IL10 genes might contribute to an increased risk for development and progression of IgAN.

show abstract

Section: Discussionmentioning

confidence: 99%

Interleukin Variants Are Associated with the Development and Progression of IgA Nephropathy: A Candidate-Gene Association Study and Meta-Analysis

Chronopoulou,

Tziastoudi,

Pissas

et al. 2023

IJMS

Self Cite

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

ДОСЛІДЖЕННЯ АСОЦІАЦІЙ МІЖ ПОЛІМОРФІЗМОМ G308A ГЕНА TNFα ТА Клініко-Неврологічними, НЕЙРОВІЗУАЛІЗАЦІЙНИМИ, ГЕМОДИНАМІЧНИМИ ХАРАКТЕРИСТИКАМИ І КОГНІТИВНОЮ ДИСФУНКЦІЄЮ У ПАЦІЄНТІВ ІЗ СУДИННОЮ ЕНЦЕФАЛОПАТІЄЮ ПРИ ХРОНІЧНІЙ ІШЕМІЇ МОЗКУ

Дуве

2023

MCCh

View full text Add to dashboard Cite

Вступ. Фактор некрозу пухлини-α (TNFα) бере участь у нейрозапаленні, що є важливою ланкою патогенезу судинної енцефалопатії при хронічній ішемії мозку (ХСЕ), а поліморфізм гена TNFα може істотно впливати на схильність до виникнення асоційованих із нейрозапаленням захворювань та зумовлювати тяжкість їх перебігу. Мета дослідження – встановити ймовірні асоціації між поліморфним варіантом G308A гена TNFα та клініко-неврологічними, нейровізуалізаційними, гемодинамічними характеристиками і когнітивною дисфункцією у пацієнтів із ХСЕ. Методи дослідження. Обстежено 145 пацієнтів із ХСЕ, які перебували на стаціонарному лікуванні на базі комунального некомерційного підприємства “Тернопільська обласна клінічна психоневрологічна лікарня” впродовж 2021–2022 рр., з них 18 хворим проводили молекулярно-генетичне дослідження. Контрольну групу становили 12 практично здорових осіб. Клініко-неврологічне дослідження проводили за стандартною схемою, нейровізуалізаційне дослідження головного мозку – за допомогою мультиспіральної комп’ютерної томографії (апарати фірми “Asteiоn 4 Toshiba” або “Toshiba Aquilion TSX-101A/QC”, Японія) чи магнітно-резонансної томографії (“Siemens Magnetom Аvanto” 1.5 Т, з передовою технологією TIM, Німеччина). Стан церебрального кровотоку вивчали, виконуючи транскраніальне дуплексне сканування інтракраніальних судин та екстракраніальних відділів брахіоцефальних судин на апараті “Philips HDI”. Когнітивні функції оцінювали за допомогою Монреальського когнітивного тесту (MOCA). Молекулярно-генетичне дослідження поліморфного варіанта G308A гена TNFα проводили в молекулярно-генетичній лабораторії державного закладу “Референс-центр з молекулярної діагностики МОЗ України” (Київ). Статистичну обробку результатів здійснювали за допомогою програми STATISTICA 13.0. Результати й обговорення. При аналізі залежності клініко-неврологічних синдромів, нейровізуалізаційних, гемодинамічних характеристик та когнітивної дисфункції від поліморфного варіанта G308A гена TNFα у пацієнтів із ХСЕ вірогідні відмінності в розподілі частот генотипів встановлено лише для нейровізуалізаційних змін (наявність/відсутність розширення субарахноїдальних просторів, χ2=8,33; p=0,016). Щодо розподілу частот алелів поліморфного варіанта G308A гена TNFα у пацієнтів із ХСЕ, то виявлено вірогідне переважання носіїв алеля А серед осіб з наявним розширенням субарахноїдальних просторів стосовно осіб з відсутнім їх розширенням (91,67 % проти 8,33 %). Висновок. Поліморфізм G308A гена TNFα впливає на структурні зміни головного мозку в осіб із ХСЕ, що потребує продовження вивчення із залученням більшої вибірки пацієнтів.

show abstract

The study of Associations between TNFα GENE G308A polymorphism and clinical-neurological, neuroimaging, hemodynamic characteristics and cognitive dysfunction in patients with post-infectious encephalopathy

Duve

2023

PNMP

View full text Add to dashboard Cite

Introduction. Infectious diseases can affect brain function and cause the development of encephalopathy, even if the pathogen does not directly affect the central nervous system. Infections caused by viruses, bacteria, or parasites can lead to a secondary inflammatory response in the brain, commonly known as neuroinflammation, through the action of inflammatory mediators that affect the brain endothelium and parenchyma, and the response of brain cells to these mediators. Neurological consequences associated with infectious diseases are poorly understood. Nowadays, there is no established strategy for the treatment or prevention of neurological damage associated with peripheral infections. Aim of study was: to establish probable associations of the G308A polymorphic variant of the TNFα gene with clinical-neurological, neuroimaging, hemodynamic characteristics and cognitive dysfunction in patients with post-infectious encephalopathy. Material and methods. 128 patients with PIE who were undergoing treatment in the neurological departments of the communal non-profit enterprise "Ternopil Regional Clinical Psychoneurological Hospital" during 2021-2022 were examined. 26 patients underwent molecular genetic analysis. The control group consisted of 12 practically healthy persons, representative in terms of age and sex. All patients met the inclusion criteria for the study. Neuroimaging was performed using multispiral computed tomography (CT) or magnetic resonance imaging (MRI). The state of cerebral blood flow was studied using transcranial duplex scanning (TCI) of intracranial vessels and extracranial brachiocephalic vessels on a Philips HDI device. Research in the cognitive sphere was carried out using the Montreal Cognitive Test (The Montreal Cognitive Assessment, MoCA). The molecular genetic study of the G308A polymorphic variant of the TNFα gene was carried out according to standard protocols developed in the molecular genetic laboratory of the state institution "Reference Center for Molecular Diagnostics of the Ministry of Health of Ukraine". The results. Analyzing the dependence of clinical-neurological syndromes, neuroimaging, hemodynamic characteristics, and cognitive dysfunction on the polymorphic variant G308A of the TNFα gene in patients with PIE, probable differences in the distribution of genotype frequencies were established only for clinical-neurological syndromes (cephalic syndrome, p=0.005 and movement disorder syndrome, p =0.038) and neuroimaging changes (gliosis phenomenon, p=0.026). Regarding the frequency distribution of alleles of the G308A polymorphic variant of the TNFα gene in patients with PIE, a probable predominance of carriers of the A allele among persons with cephalic syndrome compared to persons without cephalic syndrome was found (91.67% vs. 8.33%). Conclusions. Thus, the allelic polymorphism of the TNFα gene affects the course of PIE, which determines the expediency of further research.

show abstract

Tumor Necrosis Factor-α G-308A Polymorphism and Sporadic IgA Nephropathy: A Meta-Analysis Using a Genetic Model-Free Approach

Cited by 3 publications

References 58 publications

Interleukin Variants Are Associated with the Development and Progression of IgA Nephropathy: A Candidate-Gene Association Study and Meta-Analysis

Interleukin Variants Are Associated with the Development and Progression of IgA Nephropathy: A Candidate-Gene Association Study and Meta-Analysis

The study of Associations between TNFα GENE G308A polymorphism and clinical-neurological, neuroimaging, hemodynamic characteristics and cognitive dysfunction in patients with post-infectious encephalopathy

Contact Info

Product

Resources

About