Unusual chromosomal polymorphism of the common shrew, Sorex araneus L., in southern Belarus

Kryshchuk, Iryna A.; Орлов, В. Н.; Cherepanova, E. V.; Borisov, Yuri M.

doi:10.3897/compcytogen.v15.i2.63084

Cited by 5 publications

(2 citation statements)

References 17 publications

Supporting

Mentioning

Contrasting

Unclassified

Order By: Relevance

“…Важно подчеркнуть, что описанные цитотипы включали не только робертсоновские транслокаци, слияния и расщепления хромосом, но и тандемные повторы, парацентрические и перицентрические инверсии. Вовлеченность центромерных и теломерных повторов во внутривидовую изменчивость и формирование внутривидовых хромосомных рас хорошо известна у ряда видов землероек (116), три варианта внутривидовых хромосомных рас («робертсоновские веера») описаны Н.Н. Воронцовым (117) у мышей рода Leggada, домовых мышей Mus domesticus надвида Mus musculus и слепушонка группы Ellobius tancrei, относящейся к надвиду Ellobius talpinus.…”

unclassified

DNA MARKERS AND MICROSATELLITE CODE (review)

Glazko¹

2023

S-h. biol.

View full text Add to dashboard Cite

Одной из центральных проблем в современном животноводстве остается поиск генетических маркеров, которые упростили бы отбор и подбор животных для скрещиваний и повысили вероятность получения потомства с желательными хозяйственно ценными признаками. В обзоре рассмотрены примеры наиболее успешного применения различных типов ДНК маркеров для решения конкретных селекционных задач: микросателлитов -для исключения ошибок происхождения, мононуклеотидных полиморфизмов (SNP) -для создания карт геномных районов, полиморфизм в которых ассоциирован с модификацией фенотипических характеристик (D.J. Rigden, X.M. Fernández, 2023) и локализацией ключевых генов адаптации к давлению естественного отбора на краях ареалов и в зонах рискованного животноводства (E.K. Cheruiyot с соавт., 2022; L. Buggiotti с соавт., 2021, 2022), областей с повышенным варьированием копийности геномных участков (CNV) -для анализа механизмов ответа полигенных систем (сенсорных, иммунных, транспортерных) на воздействие факторов естественного и искусственного отбора (Y. Huang с соавт., 2021; P. Davoudi с соавт., 2022). Обсуждается преимущественное вовлечение диспергированных и тандемных повторов (в частности, микросателлитных) как элементов регуляторных сетей в эпигенетическую и фенотипическую изменчивость (R.P. Kumar с соавт., 2010). Рассматривается сложная структурно-функциональная организация микросателлитов, индивидуальная изменчивость некоторых локусов, их участие в процессах эволюции, рекомбинации, транскрипции, в формировании вторичной структуры ДНК, модификации архитектоники интерфазного ядра, в регуляции профилей генной экспрессии (R.P. Kumar с соавт., 2010; X. Tang с соавт., 2022). Исследования регуляторных сетей приобретают особое значение в связи с накоплением информации о существенных различиях по размерам генома у животных разных таксонов, распространенности и составу мобильных генетических элементов (источников компонентов регуляторных сетей) при сходстве числа генов, кодирующих белки (В.И. Глазко с соавт., 2022). Эти данные свидетельствуют о перспективности полилокусного генотипирования на основе микросателлитных и диспергированных повторов для выявления особенностей популяционно-генетической структуры, консолидированности и различий между группами животных.

show abstract

unclassified

DNA MARKERS AND MICROSATELLITE CODE (review)

Glazko¹

2023

S-h. biol.

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

“…It is important to emphasize that the described cytotypes included not only Robertsonian translocations, chromosome fusions and splits, but also tandem repeats, paracentric and pericentric inversions. The involvement of centromeric and telomeric repeats in intraspecific variability and the formation of intraspecific chromosomal races is well known in a number of shrew species [116]; three variants of intraspecific chromosomal races ("Robertsonian fans") were described by N.N. Vorontsov [117] in mice of the genus Leggada, house mice Mus domesticus of the superspecies Mus musculus and mole voles of the group Ellobius tancrei, belonging to the superspecies Ellobius talpinus.…”

mentioning

confidence: 99%

ДНК МАРКЕРЫ И «МИКРОСАТЕЛЛИТНЫЙ КОД» (Обзор)

ГЛАЗКО

2023

S-h. biol.

View full text Add to dashboard Cite

The search for genetic markers that simplify the selection of animals for crosses, increasing the likelihood of offspring obtaining with the desired manifestation of economically valuable traits is a central problem in modern animal husbandry. Here, we discuss the most successful applications of various types of DNA markers of genomic element polymorphisms for solving specific breeding problems. Microsatellites are used to exclude errors of origin, single nucleotide polymorphisms (SNPs) to create maps of genomic regions in which polymorphism is associated with the variability of phenotypic characteristics (D.J. Rigden, X.M. Fernández, 2023) and to identify the localization of key genes of adaptation to natural selection factors at the natural habitat edges and in areas of animal husbandry risky (E.K. Cheruiyot et al., 2022;L. Buggiotti et al.., 2021L. Buggiotti et al.., , 2022. The loci of increased variability in the copyicity of genome regions (CNV) are used to assess their involvement in responses to natural and artificial selection factors of such polygenic systems as sensory, immune, and transporter (Y. Huang et al., 2021; P. Davoudi et al., 2022). The predominant involvement of regulatory networks including dispersed and tandem repeats, in particular microsatellite repeats, in epigenetic and phenotypic variability is discussed (R.P. Kumar et al., 2010). The structural and functional complexity of microsatellite loci, individual features of variability of specific loci and their participation in evolutionary, recombination, transcription processes are considered. Their involvement in the organization of secondary DNA structures, participation in the formation and variability of the architectonics of the interphase nucleus and regulation of gene expression profiles is noted (R.P. Kumar et al., 2010; X. Tang et al., 2022). The study of regulatory networks is of particular importance, since there is evidence that the size of the genome in animals of different taxa, as well as the distribution and composition of mobile genetic elements (sources of components of regulatory networks) differ significantly, in contrast to the similarity in the number of genes encoding proteins (V.I. Glazko et al., 2022). Accumulating evidence suggests that polylocus genotyping of individual microsatellites and dispersed repeats can contribute to solving practical problems, such as information on the specific features of the population-genetic structure, consolidation and differences between closely related groups of animals.

show abstract