The streaked prochilod Prochilodus lineatus (Valenciennes) is a commercially freshwater species from South America, distributed in the Plata basin. In the present work the morphometry (circularity, rectangularity, form factor, OL/OW and ellipticity indices) and chemistry (Sr:Ca, Ba:Ca, Zn:Ca) of lapilli otolith, and geometric morphometry of scales of streaked prochilod juveniles, in two sites in the Plata basin (Uruguay River and Estrella Wetland), were compared to determine if they are area-specific and to identify possible breeding areas. Otolith Ba:Ca ratios was 0.017±0.003 mmol/ mol for Uruguay River while for Estrella Wetland individuals was bellow the detection limits. Zn:Ca ratios tended to be higher for the latter (0.03±0.002 mmol/mol). Significantly high circularity and low rectangularity values were obtained for Estrella Wetland otoliths (p < 0.05), while no significant differences for form factor, OL/OW and ellipticity were observed between sampling sites. Considering all scale geometric morphometry variables, discriminant analysis showed a good percentage of classification of individuals (90.5% for Estrella Wetland and 85.7 % for Uruguay River). These results indicate that the otolith microchemisty and morphometry (circularity and rectangularity indices) and scale morphometry are good markers of habitat and represent a potential tool for identification of streaked prochilod nursery areas.El sábalo Prochilodus lineatus (Valenciennes) es una especie de importancia comercial de agua dulce de Sudamérica, distribuida en la cuenca del Plata. En este trabajo se comparó la morfometría (índices de circularidad, rectangularidad, factor de forma, OL/OW y elipticidad) y microquímica (Sr:Ca, Ba:Ca y Zn:Ca) del otolito lapilli, y la morfometría geométrica de las escamas de sábalos juveniles capturados en dos sitios de la cuenca del Plata (Río Uruguay y bañado la Estrella), para determinar si existen diferencias área-especificas e identificar posibles sitios de cría. La relación Ba:Ca del otolito fue 0.017±0.003 mmol/mol para el río Uruguay mientras que estuvo por debajo del límite de detección para los individuos del bañado la Estrella. La relación Zn:Ca tendió a ser más alta en el bañado la Estrella (0.03±0.002 mmol/mol). Se obtuvieron valores significativamente altos de circularidad y bajos de rectangularidad para el bañado la Estrella (p < 0.05), mientras que no se hallaron diferencias para el factor de forma, OL/OW y elipticidad. Considerando la morfometría geométrica de las escamas, el análisis discriminante mostró buenos porcentajes de clasificación (90.5% para el bañado la Estrella y 85.7 % para el Río Uruguay). Estos resultados indican que la microquímica y morfometría del otolito (índices de rectangularidad y circularidad) y la morfometría de las escamas son buenos marcadores de hábitat y representan una herramienta potencial para la identificación de sitios de cría del sábalo.