O uso de células-tronco na medicina demonstra inúmeras possibilidades terapêuticas, entretanto, não há resultados a longo prazo destes tratamentos até o momento, gerando incerteza quanto à sua utilização, tanto na comunidade médica e para os pacientes. Um estudo que apresente sistematicamente o estado da arte do uso clínico destas células seria esclarecedor tanto para o meio médico quanto para os pacientes. Diante disso, este trabalho tem por objetivo descrever as aplicações clínicas disponíveis no Brasil para o uso de células-tronco em diferentes especialidades médicas. Realizou-se uma revisão sistemática de caráter exploratório da literatura presente nas bases de dados Lilacs, Ibecs, Medline e Scielo, com os descritores Células-tronco, Medicina regenerativa, Terapia baseada em transplante de células e tecidos e Transplante de células-tronco. Foram selecionados 20 artigos de acordo com o cumprimento do objetivo e critérios metodológicos, abrangendo ás áreas médicas da hematologia, cardiologia, oftalmologia, reumatologia, ortopedia, cirurgia vascular e dermatologia. Conclui-se que o tratamento com células-tronco é empregado de forma definitiva ou adjuvante a outras terapias nas áreas médicas supracitadas, diminuindo em alguns casos o emprego de terapias mais agressivas ou a minimização dos efeitos colaterais associados a estas, além de trazer resultados que não poderiam ser conseguidos anteriormente.