Variabilidade genética em acessos de caupi analisada por meio de marcadores RAPD

Abstract

Resumo -O conhecimento da variabilidade genética e da relação entre diferentes acessos de caupi é importante para maximizar o uso dos recursos genéticos disponíveis. Esse trabalho teve como objetivo avaliar a variabilidade genética em 45 acessos de caupi (Vigna unguiculata (L.) Walp.) oriundos do Brasil, EUA e Nigéria, por meio de marcadores RAPD. Foram encontrados 8 iniciadores polimórficos e um total de 48 bandas informativas. De acordo com os perfis polimórficos obtidos, foi observada a formação de quatro grupos genotípicos. Houve uma tendência de agrupamento em razão da origem dos acessos. A maioria dos acessos de variedades locais brasileiras pertence apenas a um grupo, o que sugere uma limitação da base genética. Vale ressaltar que nesse grupo não estavam presentes acessos da Nigéria considerados portadores de características agronômicas superiores, como, por exemplo, alta produtividade. RAPD é uma ferramenta eficiente, capaz de auxiliar a seleção de genótipos de caupi adaptados às diferentes condições edafo-climáticas brasileiras, com vistas ao aumento da produtividade e melhoria de outras características que atendam aos interesses regionais específicos.Termos para indexação: Vigna unguiculata, marcador molecular, polimorfismo genético, variedade local, análise de agrupamento. Cowpea genetic variability analyzed by RAPD markersAbstract -The knowledge on genetic variability and the relationship among different cowpea accesses is important to maximize resource use represented by available cowpea genotypes. The objective of this work was to determine the genetic variability among 45 cowpea (Vigna unguiculata (L.) Walp.) accesses from Brazil, USA and Niger, characterized by RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) markers. Eight polymorphic primers were identified, comprehending a total of 48 informative bands. Based on the obtained polymorphic profiles, four major clusters were formed. Clustering was mainly influenced by the genotype origin. Most accesses from Brazilian landraces belong to just one cluster, suggesting a limited genetic basis. It is worth noting that none of the genotypes from Niger considered as possessing superior agronomical traits, such as high productivity, was present in this cluster. RAPD shows to be an efficient tool, capable of assisting cowpea genotype selection adapted to Brazilian edaphoclimatic conditions, aiming at increasing productivity and improving other desirable characteristics to meet the needs of specific regional demands.Index terms: Vigna unguiculata, molecular marker, genetic polymorphism, Brazilian landrace, clustering analysis. IntroduçãoO caupi (Vigna unguiculata (L.) Walp.) é uma leguminosa bastante cultivada por pequenos e médios produtores das regiões Nordeste e Norte do Brasil, e mais recentemente por grandes agricultores dessas regiões. No cenário mundial, o caupi tem grande importância econômica e social, especialmente na Índia e continente africano. Devido a sua rusticidade, a espécie exibe reconhecida capacidade de adaptação frente a estresses hídrico, térmi...

Variabilidade genética entre acessos de amendoim

“…A extração de DNA foi realizada com um disco de tecido foliar jovem para todas as amostras, quantidade semelhante obtida por Xavier et al (2005) Em outro estudo, 70 acessos de amendoim, com diferentes características como tolerância à seca, período de maturação, dormência de sementes, massa de 100 sementes, conteúdo de óleo, entre outras, foram analisados com 48 iniciadores randômicos, e apenas sete (15%) iniciadores revelaram polimorfismo (Subramanian et al, 2000). Com uso de outras técnicas para revelar polimorfismo em amendoim, He & Prakash (1997) observaram polimorfismo em: 17 (3%) dos 559 iniciadores DAF (DNA amplification fingerprint); 28 (43%) dos 64 pares de iniciadores AFLP testados; e 15 dos 28 pares de iniciadores AFLP testados.…”

“…Origem, variedade botânica, grupo agronômico e hábito de crescimento dos acessos de amendoim (Arachis hypogaea), utilizados no estudo de variabilidade genética por meio de marcador molecular tipo RAPD. a extração foram testadas: um e três discos de tecido foliar com diâmetro de 1 cm, que correspondem à cerca de 10 e 30 mg, respectivamente (Xavier et al, 2005). O disco de tecido foliar foi macerado em nitrogênio líquido até o estado de pó fino, ressuspendido em tampão de extração (CTAB 2%; 20 mM EDTA; 100 mM TrisHCl pH 8; 1% mercaptoetanol) e incubado a 65 o C por 60 min.…”

“…Marcadores moleculares RAPD têm sido utilizados para estudos de variabilidade genética (Subramanian et al, 2000;Raina et al, 2001;Xavier et al, 2005) para identificação de espécies (Martin et al, 1997), para monitorar a eventual transferência de material genético de espécies diplóides selvagens para o amendoim cultivado (Garcia et al, 2006), para determinar o grau de associação entre a distância genética entre parentes e a performance dos seus híbridos (Dias et al, 2003), e para construção de mapas genéticos de ligação (Menéndez et al, 1997). A técnica do RAPD pode ser eficaz na redução do número de acessos analisados, uma vez que permite a identificação de acessos contrastantes (Xavier et al, 2005).…”

“…A técnica do RAPD pode ser eficaz na redução do número de acessos analisados, uma vez que permite a identificação de acessos contrastantes (Xavier et al, 2005).…”

“…No caso de leguminosas que se associam com bactérias diazotróficas, capazes de fixar nitrogênio atmosférico, o uso de RAPD assume importância estratégica para a identificação de especificidade entre o macro e microssimbionte, a partir da variabilidade genética vegetal (Xavier et al, 2005(Xavier et al, , 2006, o que permite a seleção de associações simbióticas mais eficientes e específicas e a aplicação biotecnológica de inoculantes rizobianos, para a otimização da fixação biológica do nitrogênio.…”