El maíz nativo presenta una gran diversidad genética, dicha diversidad ha sido de suma importancia y base del mejoramiento genético para la resistencia a sequía, pero los estudios se han concentrado en la zona del sureste del país. El presente tuvo como objetivo evaluar las características morfológicas de 55 poblaciones de maíz nativo del estado de San Luis Potosí, evaluar la interacción genotipo x ambiente y la estabilidad en el rendimiento de grano bajo condiciones de temporal estricto. Se establecieron dos parcelas experimentales, la primera en Facultad de Agronomía y Veterinaria de la Universidad Autónoma de San Luis Potosí y la segunda en la localidad de Los Cerritos, municipio de Ahualulco, bajo un diseño de bloques al azar con dos repeticiones. En la localidad de Los Cerritos se tuvo una mejor expresión fenotípica por lo cual se utilizó para la caracterización morfológica, mientras que la variable rendimiento se analizó con un análisis de varianza combinado y posteriormente se aplicó el modelo de regresión en los sitios (SREG) para estudiar la interacción. La estabilidad fue modelada utilizando la gráfica GGE biplot. El análisis de varianza para la caracterización morfológica presentó diferencias altamente significativas para todas las variables. La evaluación de interacción genotipo x ambiente mostro que las poblaciones 5, 665 y 438 fueron las más estables y con el mayor rendimiento de grano.