Abstract:Zooplankton is an important community in aquatic ecosystems due to its linkage between primary producers and secondary consumers also playing a key role in cycling of organic materials. Aim: Therefore, our objective was to evaluate the effects of physicochemical variables of the water on the diversity of zooplankton community in seven tropical shallow lakes of Brazilian savannah. Methods: Zooplankton samples were taken using a bucket and filtered 200 L by a 64 µm-mesh-plankton-net, and preserved for subsequent identification. Water temperature, dissolved oxygen, pH, electrical conductivity, turbidity, chlorophyll-a, ammonium, nitrate, nitrite, total phosphorus, and soluble reactive phosphorus were measured. Results: The turbidity (decreases the temperature, luminosity and the system productivity) and ammonium (increases the toxicity) values were the major factors responsible for structuring the zooplankton community. On the other hand, also nitrogen and phosphorus (increase the productivity) are limiting in savannah lentic systems for the zooplankton. The higher α diversity was positively associated with aquatic macrophytes (increase of niches and refuge), whereas lakes with geographic proximity increase the similarity in species composition, decreasing the β diversity. Conclusions: We conclude that the deterministic processes (niche theory), due to species have different ecological requirements, are different responses to environmental gradients and increase the diversity in heterogenic lentic systems.Keywords: α diversity; β diversity; nutrients; habitat heterogeneity; lentic systems.Resumo: O zooplâncton é uma comunidade importante nos ecossistemas aquáticos por ser o elo entre os produtores primários e os consumidores secundários, além de desempenharem um papel fundamental no ciclo de materiais orgânicos. Objetivo: Nosso objetivo foi avaliar os efeitos das variáveis físicas e químicas da água na diversidade de zooplâncton em sete lagoas rasas tropicais da savana brasileira. Métodos: As amostras de zooplâncton foram coletadas usando balde e filtrando 200 litros em rede de plâncton com abertura de 64 µm, e preservadas para posterior identificação. A temperatura da água, oxigênio dissolvido, pH, condutividade elétrica, turbidez, clorofila-a, amônio, nitrato, nitrito, fósforo total, fósforo reativo solúvel, cobertura de macrófita da lamina d'água foram obtidos. Resultados: A turbidez (ao diminui a temperatura, a luminosidade e a produtividade do sistema) e os valores de amônio (por aumenta a toxicidade) foram os principais fatores responsáveis pela estruturação do zooplâncton. Por outro lado, o nitrogênio e o fósforo (por aumentar a produtividade) são limitantes para o zooplâncton nos sistemas lênticos de savana. A maior diversidade α foi associada 2 Padovesi-Fonseca, C. and Rezende, R.S.