La arqueología subacuática en Latinoamérica y el Caribe hasta hace pocos años se había enfocado exclusivamente en el estudio de pecios, principalmente aquellos de la Carrera de Indias. Sin embargo, ante el desarrollo mismo de la disciplina en nuestra región, el intercambio de experiencias y la formación académica, se han abierto nuevas líneas de investigación, que buscan implementar y adaptar preceptos metodológicos y técnicos del Viejo Continente a nuestras realidades locales. Este es el caso puntual de la arqueología portuaria, línea de interés que busca dar cuenta del uso, la funcionalidad y la operatividad, así como las transformaciones de las antiguas cuencas portuarias a partir del estudio geoarqueológico, geoquímico y archivístico. En este artículo se propone lo anterior a partir de la propuesta de una definición conceptual y operativa del puerto y el paisaje portuario como hecho arqueológico, para esto se presenta un modelo de estudio y su aplicabilidad al otro lado del Atlántico en una serie de investigaciones que se vienen desarrollando hace más de cincuenta años y sus semejantes en algunos países americanos. Se propone, desde algunos resultados obtenidos en el estudio portuario que venimos desarrollando en la bahía de Las Ánimas, en Cartagena de Indias, Colombia, cómo este enfoque puede ayudarnos a entender el impacto que habría tenido el desarrollo de actividades asociadas al ciclo económico de la ciudad con la construcción y el ordenamiento del sistema portuario, pero también cómo este enfoque aplicado sistemáticamente puede ofrecernos un panorama más amplio de manera integral en nuestro continente.