МОДЕЛИРОВАНИЕ САМОСБОРКИ 5-Гидрокси-6-Метилурацила В РАМКАХ ЭЛЕКТРОСТАТИЧЕСКОГО ПОТЕНЦИАЛА, "Журнал Физической Химии"

Abstract

Проведено детальное теоретическое исследование реакционных сайтов в молекуле 5-гидрокси-6-метилурацила (ГМУ) и его димерных и тетрамерных ассоциатов в терминах электростатического потенциала (ESP). Показано, что подход ESP позволяет конструировать наиболее устойчивые комбинации ассоциатов ГМУ, изучать самосборку ГМУ, минуя этап моделирования всех возможных ассоциатов. Предложена схема самосборки ГМУ: первоначально между молекулами образуются связи N1-H…O1, далее при условии, что 1 центр распознавания (ЦР) занят, образуются связи N3-H…O2 с участием 3 ЦР; образующиеся ленты с чередованием контактов 1-1 и 3-3 сшиваются между собой за счет электростатического притяжения гидроксогрупп и дисперсионных сил между метильными группами.