Сhewable composition as an alternative way of extracting biological material for the study of the genome and DNA viruses of human

Abstract

Для проведения молекулярно-генетических ис-следований, как правило, используются такие спо-собы получения биологического материала, как венопункции для взятия образцов крови, получе-ние соскобов буккального эпителия или образцов слюны. При этом для большинства молекулярно-генетических тестов в клинико-диагностических лабораториях исследование образцов крови по-прежнему остается единственным стандартизован-ным методом.Ранее нами был предложен метод взятия био-логического материала при помощи жевательных композиций на основе латексной жевательной ре-зинки и серки лиственницы [1]. Метод основан на адсорбции клеток содержимого ротовой полости на жевательных композициях. При этом количество получаемого ДНК-содержащего материала зависит от свойств жевательной композиции, длительности контакта и особенностей клеточного состава слизи-стой полости рта. Кроме буккальных эпителиальных Показана возможность использования жевательных композиций в качестве альтернативного способа неинвазивного взя-тия биоматериала для проведения молекулярно-генетических исследований с целью выявления наследственных полимор-физмов в геноме человека (на примере определения таких полиморфизмов, как C677Т, R577X, K153R и P582S в генах MTHFR, ACTN3, MSTN и HIF1A соответственно), соматической мутации V617F в гене JAK2, а также ДНК вируса гепатита В. Модифицированная методика выделения ДНК из клеток, адсорбированных жевательными композициями, позволяет проводить молекулярно-генетические исследования, сравнимые по чувствительности и специфичности с традиционными методами тестирования ДНК из венозной крови.Ключевые слова: выделение ДНК, жевательные композиции, неинвазивное получение биоматериала, гены спортивной предрасположенности, мутация V617F в гене JAK2, гепатит В. In this work we present the possibility of using chewing compositions as an alternative non-invasive method of obtaining a biomaterial for molecular genetic studies to identify genetic polymorphisms in the human genome (for example, C677T, R577X, K153R and P582S in the genes of MTHFR, ACTN3, MSTN and HIF1A, respectively), somatic mutation V617F in the gene JAK2, and HBV DNA. A modified method of DNA extraction from cells which are adsorbed on the chewable composition allows to conduct molecular genetic studies that in their sensitivity and specificity comparable to traditional methods of testing DNA from venous blood.

On the issue of validation of the method for somatic mutations determining in Janus kinase-2 (JAK2V617F), calreticulin (CALR) and receptor of thrombopoietin (MPL) genes in the dry blood drops

“…Хранение и транспортировка пробирок с венозной кровью сопряжены с определенными трудностями обеспечения безопасности и преаналитической надежности проб. Ранее в нашей лаборатории была показана возможность выявления мутации V617F JAK2 в материале, полученном неинвазивным путем (при использовании жевательных композиций) [2], однако эта альтернативная технология, в отличие от тестирования цельной крови, не позволяет гарантировать точность количественного определения нагрузки мутантного аллеля.…”