A study has been carried out on the acid soluble fraction (hydrosysis at pH 1.5, 3N HC1, 20 % KG) of organic matter (OM) in the highly calcareous lacustrine sediments of the Jura region, France. Amino acids (AA's) were quantified and determined ninhydrin photometry and HPLC respectively. There was a high degree of interference by calcium in both procedures. The mechanism of interference is explained and methodology adopted to overcome it, by removal of calcium, are dealt with. The results of both methods are compared. Dosage des acides a-aminés dans les sédiments lacustres jurassiens en présence de fortes teneurs en CaCC^. Comparaison de deux méthodes : colorimétrique et chromatographiqueMots clés : acides aminés, calcium, sédiment, lac, CLHP, ninhydrine.Des études sont réalisées sur des sédiments de nombreux lacs Jurassiens, à matrice calcaire. Elles portent en particulier sur la matière organique. Nous nous sommes particulièrement intéressés à la fraction acidosoluble extraite à pH 1.5 à l'aide de HC1 3N à 20 % KC1 et avons cherché à quantifier globalement les acides aminés puis à identifier les plus abondants d'entre eux. Que ce soit pour le dosage global, par colorimétrie ou pour leur identification par CLHP, nous avons rencontré des difficultés dues à une forte teneur en calcium dans nos échantillons. Nous traitons ici du rôle du calcium sur les deux méthodes analytiques, de son élimination et comparons les résultats des deux méthodes.