Many studies have examined whether longitudinal variation exists in fish communities within stream channels. Yet despite the acknowledged importance of adjacent floodplain ecosystems, no study has investigated longitudinal variation in fish communities in floodplain wetlands. We conducted a study to determine if distinct fish communities exist between upper and lower river floodplains. We predicted that floodplains in the upper portions of a watershed will be dominated by opportunistic riverine fish. In contrast, floodplains farther downstream in the watershed will primarily consist of obligate floodplain fishes. We sampled fishes at 21 floodplain sites along the lengths of the Oconee-Altamaha and Broad-Savannah river systems of Georgia, USA, during the 2008 and 2009 flood seasons. A modified mark-recapture method was utilized to estimate probabilities of species detection and occupancy. Ordination and analysis of similarity using species site occupancy estimates identified two unique communities related to floodplain position, and indicator species analysis supported our hypothesis of community distinction based on life history traits. Water resource managers should consider how flood pulse character influences fish communities when regulating flow regimes. Résumé :De nombreuses études se sont penchées sur l'existence possible de variations longitudinales des communautés de poissons dans les chenaux de cours d'eau. Pourtant, malgré l'importance reconnue des écosystèmes des plaines inondables attenantes, aucune étude n'a examiné les variations longitudinales des communautés de poissons dans les milieux humides de plaines inondables. Nous avons réalisé une étude visant à déterminer s'il existe des différences entre les communautés de poissons des plaines inondables des cours supérieurs et inférieurs de rivières. Nous avions prédit que les plaines inondables dans les portions supérieures d'un bassin versant seraient dominées par des poissons fluviatiles opportunistes, alors que les plaines inondables situées plus en aval présenteraient principalement des poissons inféodés à ces milieux. Nous avons prélevé des poissons dans 21 sites de plaine inondable le long des réseaux hydrographiques des rivières Oconee-Altamaha et BroadSavannah en Géorgie (États-Unis), durant les périodes de crue de 2008 et 2009. Une méthode de marquage-recapture modifiée a été employée pour estimer les probabilités de détection et d'occupation des espèces. L'ordination et l'analyse de similitude basées sur des estimations de l'occupation des sites par différentes espèces ont permis de cerner deux communautés distinctes selon la position de la plaine inondable, et l'analyse d'espèces indicatrices appuie notre hypothèse de la distinction des communautés selon les caractères du cycle de vie. Dans la prise de décisions touchant à la régulation des régimes d'écoulement, les gestionnaires de ressources hydriques devraient tenir compte de l'influence des caractéristiques des crues ponctuelles sur les communautés de poissons. [Traduit par la Rédaction]