No abstract

Öz Farklı nörolojik hastalıkların neden olduğu beyinde oluşan anormal durumlar dünya çapında birçok insanı etkilemektedir. Bu anormal durumlardan birisi de Amyotrofik lateral skleroz (ALS)'dur. ALS, beyin sapı adı verilen bölgede motor sinir hücrelerinin zarar görmesiyle ilerleyen fiziksel bozukluklara neden olan genellikle motor nöron hastalığı olarak bilinen bir hastalıktır. Beyin, dışarıdan gelen uyarıları algılar ve algılanan çok sayıda uyarıdan ilgili olanları dikkat mekanizması sayesinde seçer. Dikkat, çeşitli bilgi türlerinin, duygu ve düşünceler gibi aktivitelerin bir bölgeye yoğunlaştırılıp gerekli sürede ilgili uyarıcıların beyin tarafından seçilmesiyle oluşan bilişsel bir süreçtir. Elektroensefalogram (EEG) beynin dikkat mekanizmasında oluşan bu tür aktiviteleri ölçmek ve analiz etmek için önemli bir yere sahiptir. Dikkat analizi için son yıllarda yapılan çalışmalar Olaya İlişkin Potansiyel (OİP) sinyalleri üzerinedir. OİP sinyalleri, EEG sinyallerinde net olarak gözükmeyen P100, N200, P300 ve N400 gibi bileşenlere sahip olan küçük genlikli sinyallerdir. Bu nedenle OİP sinyallerini elde edebilmek için hedef uyaranın tekrarlanması, birçok kez EEG kaydının alınması gerekmektedir. Kayıt alınan hedef uyarana ait EEG sinyallerinin ortalamasının alınması sonucunda OİP sinyalleri elde edilmektedir. Gerçekleştirilen çalışmada, ALS hastaları ile sağlıklı kişilerin OİP sinyallerinden bir takım özelliklerin elde edilip ve görsel uyaranlara karşı dikkat analizinin k-ortalamalar kümeleme yöntemi ile incelenmesi amaçlanmıştır. K-ortalamalar kümeleme yöntemi ile yapılan inceleme sonucunda veriler 2 kümeye ayrılmış ve en yüksek başarı oranı %77.78 olarak hesaplanmıştır.

Proton magnetic resonance spectroscopic imaging (1H-MRSI) provides noninvasive evaluation of brain metabolism. However, there are some limitations of 1H-MRSI preventing its wider use in the clinics, including the spectral quality issues, partial volume effect and chemical shift artifact. Additionally, it is necessary to create metabolite maps for analyzing spectral data along with other MRI modalities. In this study, a MATLAB-based open-source data analysis software for 3D 1H-MRSI, called Oryx-MRSI, which includes modules for visualization of raw 1H-MRSI data and LCModel outputs, chemical shift correction, tissue fraction calculation, metabolite map production, and registration onto standard MNI152 brain atlas while providing automatic spectral quality control, is presented. Oryx-MRSI implements region of interest analysis at brain parcellations defined on MNI152 brain atlas. All generated metabolite maps are stored in NIfTI format. Oryx-MRSI is publicly available at https://github.com/sevimcengiz/Oryx-MRSI along with six example datasets.

Proton magnetic resonance spectroscopic imaging ( 1 H-MRSI) provides a noninvasive, spatially resolved evaluation of brain metabolism. However, there are some limitations of 1 H-MRSI preventing its wider use in the clinics, including the spectral quality issues, partial volume effect and chemical shift artifact.Additionally, it is necessary to create metabolite maps for analyzing spectral data along with other MRI modalities. In this study, a MATLAB-based opensource data analysis software for three-dimensional 1 H-MRSI, called Oryx-MRSI, which includes modules for visualization of raw 1 H-MRSI data and LCModel outputs, chemical shift correction, tissue fraction calculation, metabolite map production, and registration onto standard MNI152 brain atlas while providing automatic spectral quality control, is presented. Oryx-MRSI implements region of interest analysis at brain parcellations defined on MNI152 brain atlas. All generated metabolite maps are stored in NIfTI format.

No abstract