Resumo Este trabalho é um estudo taxonômico da família Melastomataceae nas ilhas da Baía Babitonga, nordeste de Santa Catarina, região Sul do Brasil. A Baía compreende cerca de 160 km2 em um conjunto de 24 ilhas que abarcam cerca de 75% da área total de manguezais do estado de Santa Catarina. Foram efetuadas coletas entre 2004 e 2016, e coleções de herbários foram estudadas. Foram registradas 15 espécies, pertencentes a seis gêneros: Clidemia (2 spp.), Leandra (3 spp.), Miconia (5 spp.), Ossaea (1 sp.), Pleroma (1 sp.) e Tibouchina (3 spp.). São apresentadas chave de identificação para as espécies, descrições morfológicas, dados de distribuição geográfica e fenologia, e imagens das espécies.