A meiofuna caracteriza-se por um grupo de organismos de organizações corporais e complexidades estruturais que permitiram sua integração ao ambiente intersticial. A variabilidade temporal da meiofauna ocorre em pequenas, médias e longas escalas e esse estudo objetivou a descrição da meiofauna do Atol das Rocas, ao longo de um ano de amostragens, correspondendo ao período seco e chuvoso, em quatro piscinas internas do Atol, localizadas a sotavento e a barlavento. Foram realizadas duas expedições ao atol, em dezembro de 2011 (período de estiagem) e em maio de 2012 (período chuvoso), ambas com duração de 30 dias. Em cada piscina foram coletadas, através de mergulho livre, quatro amostras de meiofauna, formando um quadrado imaginário de aproximadamente 1m², e uma amostra de sedimento. As amostras de meiofauna foram coletadas utilizando um testemunho de PVC de 10 cm de comprimento e 2,5 cm de diâmetro e formol salino a 4% como fixador. A meiofauna do Atol das Rocas esteve presente com 13 táxons, que seguindo a ordem evolutiva dos grupos, são eles: Cnidária, Nematoda, Polychaeta, Oligochaeta, Tardigrada, Ostracoda, Náuplios, Copepoda, Tanaidacea, Acari, Aplacophora, Bivalve e Larvas de várias espécies. Os grupos Copepoda e Nematoda, representaram 41,72% e 30,67%, respectivamente, do total de organismos encontrados. No que se refere à frequência de ocorrência, os organismos foram classificados em grupos, com distribuição constante dominante: Copepoda, Nematoda, Oligochaeta, Ostracoda e Polychatea; com distribuição constante abundante: Larvas; com distribuição ocasional comum: Bivalve, Tanaidacea, e Tardigrada; e com distribuição ocasional raro: Aplacophora, Cnidaria e Náuplios. Ao analisar os dados utilizando o teste de média Tukey ao nível de 5% de probabilidade, observou-se que a interação dos fatores época e local de coleta, não foram significativos estatisticamente para a variável analisada densidade de meiofauna coletada. Porém, quando foram analisados os fatores separadamente, observou-se que para o fator local de coleta os dados foram estatisticamente significativos, onde o local Piscina Tartaruga, apresentou a maior densidade.
