ResumenEsta investigación dirige el análisis microbiológico de coliformes totales y Escherichia coli en Anadara Tuberculosa y Anadara Similis en el Archipiélago de Jambelí en la provincia de El Oro en Ecuador. Se obtuvieron muestras de cuatro puntos estratégicos en época seca (noviembre) y lluviosa (diciembre) usando el medio de cultivo Agar Chromocult en 240 conchas. En los resultados obtenidos en los cultivos de análisis, se presenció coliformes totales en Anadora Similis, con una media para el primer muestreo de 1,5x10^4 UFC/100g y segundo muestreo de 2.0x10^4UFC/100g y para Anadora Tuberculosa 1,7x10^4 UFC/100g y 2,4x10^4 UFC/100g. Entre los cuatro puntos de muestreo, el más elevado por contaminación es el punto dos con 2,1 x 10^4UFC/100g, en ambas especies no se observó presencia de Escherichia Coli. Se planteó la reducción del nivel bacteriano en las especies mediante un sistema de depuración y llevar a cocción los bivalvos antes de ingerirlos.