The genetic structure of a sample of isolates of the oomycete plant pathogen Phytophthora cinnamomi from natural and agricultural outbreaks and the long-distance movement of individual genotypes were studied using four microsatellite markers to genotype 159 isolates of Californian, Mexican, and worldwide origins. Allelic profiles identified 75 multilocus genotypes. A STRUCTURE analysis placed them in three groups characterized by different geographic and host ranges, different genic and genotypic diversity, and different reproductive modes. When relationships among genotypes were visualized on a minimum spanning network (MSN), genotypes belonging to the same STRUCTURE group were contiguous, with rare exceptions. A putatively ancestral group 1 had high genic diversity, included all A1 mating type isolates and all Papuan isolates in the sample, was rarely isolated from natural settings in California and Mexico, and was positioned at the center of the MSN. Putatively younger groups 2 and 3 had lower genic diversity, were both neighbors to group 1 but formed two distinct peripherical sectors of the MSN, and were equally present in agricultural commodities and natural settings in Mexico and California. A few genotypes, especially in groups 2 and 3, were isolated multiple times in different locations and settings. The presence of identical genotypes from the same hosts in different continents indicated that long-distance human-mediated movement of P. cinnamomi had occurred. The presence of identical genotypes at high frequencies in neighboring wildlands and agricultural settings suggest that specific commodities may have been the source of recent wild infestations caused by novel invasive genotypes.
El chile manzano al igual que otros frutos, es afectado por patógenos postcosecha que afectan la calidad. En el 2016 se observaron lesiones hundidas con micelio blanquecino en frutos de chile manzano procedentes del Estado de México. El objetivo fue identificar al agente causal del síntoma descrito en frutos, mediante la caracterización morfológica, molecular y pruebas de patogenicidad. Las pruebas de patogenicidad se realizaron en frutos con herida y sin herida, así como la caracterización morfológica y molecular. Los resultados indican que el agente causal de los síntomas del hundimiento fue Fusarium sambucinum. Los aislados se sembraron en medios de cultivo PDA, ClavelAgar y SNA, en donde formaron esporodoquios de color naranja, macroconidias hialinas con la célula basal papilada y la célula terminal en forma de pie: 24.8-35.3 ?m de largo y 3.67-4.46 ?m de ancho, de tres a cinco septos, esto fue confirmado con el análisis de secuenciación del gen tef 1? (translation elongation factor 1?). La comparación entre medias (Tukey) detectó diferencias significativas en el método de inoculación, pero no entre aislamientos sobre el fruto. Es el primer reporte en México de Fusarium sambucinum como agente causal de lesiones hundidas con micelio blanquecino en frutos de chile manzano.
El objetivo del presente estudio fue identificar morfológica y molecularmente la micoflora que posee propiedades antagonistas sobre Phytophthora cinnamomi, asociada al suelo del bosque de encino (Quercus spp.) de El Arrayanal, Colima, y de Tecoanapa, Guerrero. En estas localidades se realizaron dos muestreos de suelo colectándose muestras compuestas de suelo-raíz alrededor de los árboles con diferentes edades y condiciones sanitarias en rodales afectados por P. cinnamomi. Los hongos se identificaron morfológicamente mediante la técnica de dilución de suelo PDA-TS (papa-dextrosa- agar-tergitol-estreptomicina). Con los aislamientos obtenidos se realizaron pruebas de antagonismo in vitro. Los aislamientos de Trichoderma, Cordyceps bassiana y Paecilomyces son los que ejercieron mejor biocontrol al reducir el desarrollo de P. cinnamomi mostrando mecanismos sobresalientes de competencia por espacio y micoparasitismo. Los hongos se caracterizaron molecularmente amplifi- cando la región intergénica (ITS) de los genes ribosomales mediante la técnica de amplificación por reacción en cadena de la polimerasa (PCR). Se reportan por vez primera a C. bassiana, Cladospo- rium tenuissimun y seis especies de Trichoderma asociadas al bosque de encino en México.
La antracnosis, ocasionada por Colletotrichum coccodes, afecta solanáceas y cucurbitáceas. En México este patógeno se ha reportado en el cultivo de papa (Solanum tuberosum L.), pero no en tomate (Solanum lycopersicum). En el año 2015 se observó la presencia del síntoma de lesiones hundidas con 7 % de incidencia en frutos de tomate de muestras en campo abierto del estado de Morelos, México. El objetivo del presente estudio fue identificar al agente causal del síntoma de antracnosis en el fruto mediante características morfológicas y moleculares. El material colectado se desinfestó y sembró en medio de cultivo PDA (papa-dextrosaagar) y agar-jugo V8, a partir de lesiones hundidas en las cuales se observó formación de esclerocios, setas, conidios cilíndricos, hialinos, sin septos, de 3.16 a 4.16 μm de ancho y de 12.5 a 17.2 μm de largo con apresorios lobulados. En la caracterización molecular, las secuencias obtenidas con los inciadores ITS5/ITS4 tuvieron una similitud del 100 % con Collectotrichum coccodes. Las pruebas de patogenicidad se realizaron en frutos sanos con o sin herida y se evaluó el tamaño de la lesión cada 48 h. Los síntomas iniciales aparecieron a las 72 h y a los 8 d presentaron lesiones desde 0.5 hasta 3.25 cm de diámetro. La prueba de Tukey detectó diferencias significativas entre métodos de inoculación. Este es el primer reporte de Collectotrichum coccodes que afecta frutos de tomate en México.
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