Introdução: No final da década de 1990, iniciou-se as atividades de prevenção das infecções sexualmente transmissíveis para a atenção primária à saúde. Nas duas últimas décadas, vem ocorrendo uma ampliação da assistência de enfermeiros no tratamento dessas infecções. A Lei do Exercício Profissional da Enfermagem nº 7.498./86, garante aos enfermeiros na consulta de enfermagem o direito de realizar a prescrição de medicamentos aprovados por protocolos institucionais. Objetivo: Verificar se os enfermeiros que atuam na Atenção Primária à Saúde de Florianópolis se sentem aptos para a execução do diagnóstico e do tratamento medicamentoso das infecções sexualmente transmissíveis (IST) com base nos Protocolos de Enfermagem do município. Métodos: Pesquisa exploratório-descritiva de abordagem qualitativa realizada por meio de entrevista semiestruturada com perguntas disparadoras. Foram entrevistados dez enfermeiros assistenciais da Atenção Primária à Saúde do município. Os dados foram analisados segundo a técnica de Bardin.  Resultados: Identificaram-se duas categorias analíticas: “O enfermeiro e a (re)construção de sua prática profissional” e “O enfermeiro e a sua contribuição na qualidade de serviço na Atenção Primária à Saúde”.  Conclusões: Os enfermeiros da rede assistencial da Atenção Primária à Saúde de Florianópolis mostram-se altamente qualificados e sentem-se capazes de responder adequadamente às necessidades de sua prática profissional.