Coolia es un género que actualmente incluye ocho especies de dinoflagelados epibentónicos, siendo un grupo de interés debido a las toxinas que producen algunas especies del género (por ejemplo, cooliatoxina) y por las asociaciones que presentan con otros géneros de dinoflagelados epibentónicos toxigénicos (Ostreopsis, Amphidinium, Prorocentrum y Gambierdiscus). Existe poca información sobre la diversidad y ecología de este género en México. Los objetivos de este estudio fueron identificar mediante taxonomía integrativa (morfológica y molecular) dos aislados de Coolia (CMBAPAZ-1 y s/i 72) de la Bahía de La Paz, Golfo de California, y determinar los efectos de extractos de la macroalga Dictyota dichotoma sobre su crecimiento. Ambos aislados se cultivaron en medio GSe, con y sin extractos de macroalga: 1) medio GSe, 2) medio GSe con extracto crudo de D. dichotoma, 3) GSe con la fracción de carbohidratos de D. dichotoma, y 4) GSe con la fracción no precipitable de D. dichotoma. Los análisis morfológicos y moleculares de la región 28S del ADN ribosómico (valores bootstrap > 95%) permitieron la identificación de ambos aislados como Coolia malayensis. No hubo diferencias significativas (p < 0.05) en las abundancias celulares promedio de los aislados (CMBAPAZ-1 y s/i 72) cultivados en el medio GSe en comparación con los otros tratamientos. Las abundancias máximas registradas en las cepas CMBAPAZ-1 y s/i 72 hasta el día 28 fueron de 40,271 ± 3,018 y 43,428 ± 4,560 cél mL-1, respectivamente. Las tasas de crecimiento variaron en un rango de 0.129 a 0.139 div día-1 en ambas cepas. El extracto y las fracciones de D. dichotoma no favorecieron ni inhibieron el crecimiento de C. malayensis, por lo que no se excluye la posibilidad de que la macroalga pueda favorecer el crecimiento de este dinoflagelado en su medio natural.