A crescente urbanização do bioma Mata Atlântica demanda conhecer os processos em nível de paisagem e planejar o uso racional dos recursos naturais, atendendo a questões socioeconômicas e de conservação da biodiversidade. O objetivo deste estudo foi analisar a estrutura espacial e funcional da paisagem da região delimitada pela orla e morrarias das praias do município de Itajaí, Santa Catarina, e subsidiar a criação de uma Área de Proteção Ambiental (APA). A construção de um mapa de uso e cobertura do solo, a determinação das espécies-modelo da flora e suas interações com a fauna local são o cerne metodológico que permitiu elucidar a distribuição espacial da matriz, manchas e corredores de paisagem, bem como os processos paisagísticos funcionais existentes na área, e que devem ser considerados no planejamento da conservação.