As associações micorrízicas são estratégias utilizadas pela maioria das plantas vasculares, com o intuito de aumentar a área de absorção de água e nutrientes. No entanto, o estabelecimento dessa associação é modelado pelos fatores ambientais, entre elas a precipitação pluviométrica. O objetivo desse estudo foi avaliar a relação entre precipitação pluviométrica e a colonização microrrízica em plantas de pau-rosa e mogno. Foram realizadas coletas de raízes e solos rizosféricos nos meses de agosto/2005, dezembro/2005 e março/2006. As variáveis analisadas foram o percentual de colonização micorrízica (%), a intensidade de colonização (%) e a densidade de esporos no solo sob o plantio. De maneira geral, a colonização micorrízica foi maior no sistema radicular do pau-rosa. Os esporos micorrízicos apresentaram variação sazonal marcante, com maior densidade registrada na rizosfera do pau-rosa no mês de março, e mogno no mês de dezembro. A colonização média das raízes por FMA foi influenciada pela disponibilidade hídrica, com maior taxa de colonização e de esporos no período de maior quantidade de chuvas. O mogno apresentou maiores concentrações de Ca, Mg e, menores concentrações de Mn nas folhas do que o pau-rosa. Ambas as espécies mostraram as mesmas sequências de concentração de macronutrientes nas folhas: Ca>K>Mg>P. A sequência de concentração de micronutrientes nas folhas no pau-rosa foi Fe>Mn>Zn e no mogno foi Fe>Zn>Mn. Houve correlação significativa positiva das colonizações radiculares por fungos micorrízico-arbusculares e teores de Ca e Mg nas folhas do pau-rosa no mês de dezembro e, negativa para os teores de Zn nas folhas do mogno nos meses de março e dezembro.