Este trabalho apresenta resultados da avaliação da qualidade da água na secção do Rio São Francisco no segmento entre Três Marias e Pirapora. Foram monitorados parâmetros físico-químicos e os elementos Zn, Cd, Pb, Cr, Co, Cu, Ba, Ni, Al, Mn, Ca, Mg e Fe durante um ano; as concentrações dos metais foram obtidas por leitura em ICP-OES. Vários elementos apresentaram altos níveis de contaminação nas áreas urbano-industriais de Três Marias e Pirapora. No segmento de influência rural entre os dois centros urbanos e a jusante de Pirapora, foram observadas alterações para os metais pesados (Cd, Cu, Cr, Co e Ni), que evidenciam a necessidade de um estudo de contaminação dos solos agrícolas, principalmente irrigados, na região. A variação sazonal marca a diferença da qualidade da água no segmento no que se refere aos metais em suspensão com maiores concentrações na estação chuvosa. O Índice de Contaminação foi definido pela razão entre a concentração encontrada e os limites ambientais da Resolução Conama 357/2005. Os resultados evidenciam a degradação da qualidade da água nos centros urbano-industriais, cujos altos Ic decorrem das elevadas concentrações de Zn, Cd, Cu, Cr e Ni. Chamam atenção principalmente os valores que foram obtidos para os metais dissolvidos devido à maior possibilidade de efeitos tóxicos.. Ressalta-se a necessidade de intervenção nas áreas de maior Ic adjacentes aos centros urbano-industriais visando a melhorar a qualidade da água e responder à população local que tem forte relação com o Rio São Francisco.Palavras-chave: Metais Pesados, Qualidade da Água, Índice de Contaminação, Rio São Francisco e Uso do Solo. ABSTRACT: HEAVY METALS AND WATER QUALITY OF THE SÃO FRANCISCO RIVER IN SEGMENT BETWEEN TRÊS MARIAS AND PIRAPORA –MG: INDEX OF CONTAMINATION. This work presents heavy metal concentration measurements taken across a section of the São Francisco River, between Três Marias and Pirapora, to evaluate water quality. The physicochemical parameters and the elements Zn, Cd, Pb, Cr, Co, Cu, Ba, Ni, Al, Mn, Ca, Mg and Fe were monitored during a one year period; the concentration levels of metals were determined by ICP-OES. High contamination levels were found for many elements in Três Marias and Pirapora urban-industrial areas. The section under rural influence, located between the two urban areas and downstream from Pirapora, presented anomalous heavy metal (Cd, Cu, Cr, Co and Ni) readings. That indicates that soil contamination studies are needed, especially on irrigated soil, in agricultural areas within the region. The index is defined by the ratio between the concentrations found which results from environmental limits established by Resolution CONAMA 357/2005. The results show the degradation of water quality in urban-industrial centers, which high rates of contamination result from high concentrations of Zn, Cd, Cu, Cr and Ni. The values obtained for dissolved metals are especially worth of attention, due to the greater risk of toxic effects caused by them. We stress the need for intervention in the areas showing the highest contamination index - which are located next to urban-industrial centers - to improve water quality and meet the expectations of the locals, whose lives are strongly intertwined with the São Francisco River.Keywords: Heavy Metals, Water Quality, Contamination Index, São Francisco River and Soil Use