Las cuencas de captación son importantes unidades de estudio para el establecimiento de políticas de manejo y conservación de ecosistemas acuáticos. Los embalses son ambientes artificiales directamente influenciados por procesos físicos, químicos y biológicos a los que se someten estas cuencas hidrográficas. Estas influencias determinan las comunidades biológicas en los embalses. Muchos estudios han establecido la relación entre la comunidad del zooplancton como bioindicadora de la calidad del agua. En este contexto, el objetivo de este estudio fue evaluar los efectos de las variables físicas y químicas del agua y el uso y ocupación de la tierra en la comunidad de zooplancton del embalse de São Simão (MG/GO). Las muestras fueron recogidas en dos períodos (sequía y lluvia), en estaciones en los brazos del margen izquierdo (Estado de Minas Gerais) y margen derecho (Estado de Góias) y en el canal principal región limnética del embalse de São Simão. La mayoría de los parámetros físicos y químicos no superaron los límites de calidad del agua y el Índice de Estado Trófico presentó valores entre 39 y 48, clasificando el embalse de São Simão como ultraoligotrófico u oligotrófico. La comunidad del zooplancton caracterizase por la dominancia de Rotifera y Copepoda con densidades más altas en las estaciones a los márgenes derechos del embalse. La razón Calanoida/Cyclopoida clasificó 18 de 22 estaciones de muestreo como oligotróficas en la estación de sequía, pero sólo 7 en la época de lluvias. El primer Análisis de Componentes Principales, considerando los parámetros físicos y químicos, no presentó correlación con los principales grupos de zooplancton. Sin embargo, en el segundo, considerando el uso y ocupación de la tierra, se pudo verificar los efectos de las actividades humanas alrededor del embalse en la comunidad de zooplancton (74.3% de la explicación), donde se observaron densidades más altas de microcrustáceos en estaciones con más embarcaderos, bancos de macrófitas y la vegetación original ahogada, además de extensas áreas de cultivos, ganadería u ocupación humana, predominando en el margen derecho del embalse de São Simão, en el Estado de Goiás. Aunque pueden ser espúrias, estas correlaciones no pueden ser ignoradas porque reflejan, aunque sea indirectamente, el proceso de eutrofización que este embalse se somete.