En este trabajo se discuten los impactos del proceso de transición del campo mexicano hacia el libre comercio que ocurrieron en el contexto del Tratado de Libre Comercio de América del Norte (TLCAN) sobre la estructura social, productiva y ambiental del sector. El análisis tiene como fin revisar las decisiones y acciones del Estado en este periodo con el fin de ponerlos en perspectiva frente a las consecuencias ecológicas de la erosión genética del maíz y su relación con lo pactado en el apartado de biotecnología en el Tratado entre México, Estados Unidos y Canadá (T-MEC). El análisis retoma conceptos de la Economía Política Internacional que discute el papel del Estado en el control de los mercados para lograr el desarrollo (Gray, 2000; Gilpin, 2001; Hart & Prakash, 1997), y de las teorías de la economía sobre la provisión de bienes públicos necesarios para la operación económica y el desarrollo. Se analiza la transición al libre comercio desde 1992 hasta 2010 cuando concluye la liberalización arancelaria del TLCAN. El análisis abarca cuatro aspectos centrales de la transición al libre comercio: (a) la reforma agrícola mundial, el TLCAN y la creación de mercados (b) la construcción del proyecto nacional agrícola, (c) la gestión de la transición y los desenlaces en el sector social, la erosión genética y las prácticas comunitarias, (d) el T-MEC y sus normativas sobre biotecnología.