Esta pesquisa investigou os desafios da relação escola-família, durante a pandemia da COVID-19 e do ensino remoto emergencial, por meio da percepção dos professores. Realizou-se uma pesquisa exploratória de corte transversal e abordagem qualitativa. Participaram 106 professores da educação básica de escolas localizadas no Estado do Rio de Janeiro que responderam a Escala Relação Família Escola (RFE), adaptada e abreviada para a pesquisa e uma questão aberta relacionada aos desafios da relação escola-família na pandemia. Os resultados das análises quali-quantitativa revelaram que os professores reconhecem que o bom relacionamento entre a escola e a família traz benefícios para desenvolvimento dos estudantes. No entanto, culpabilizam às famílias pelos problemas que alunos apresentam na escola, desconfiam da qualidade do apoio dos pais no acompanhamento de estudos dos filhos e apontam que os mesmos não se interessam pelas atividades educativas. Com a pandemia, os professores destacaram alguns desafios de ordem sistêmica ao lidar com as famílias, envolvendo os processos de comunicação, de relacionamentos proximais, de desigualdades e injustiças sociais e de riscos à saúde socioemocional desses atores. Em conclusão, sugere-se ampliar a discussão no tocante à formação profissional de professores sobre mecanismos positivos de interações escola família, como a participação ativa e a cooperação dos pais nas experiências educacionais das crianças e adolescentes.