O comportamento biogeoquímico do carbono, nitrogênio, fósforo e metais, e os isótopos traçadores naturais da matéria orgânicaforam estudados nos sedimentos e plantas em 15 pontos no estuário do rio Passa Vaca, situado em área urbana de Salvador, Bahia, Brasil.Nos sedimentos, a ordem dos elementos investigados foi: Fe > Al > Ca > P > Na >Cu >K > Zn > Mn, para a espécie Laguncularia racemosa (L.)Gaertn observou-se: Na > Ca > K > Fe > Mn > Al > Zn > Cu; e para Rhizophora mangle L: Na > Ca > K > Mn > Fe > Al > Zn > Cu além decorrelações sedimento/planta na concentração dos elementos. Entretanto, os fatores de concentração para os metais pesados estiveramabaixo de 1 indicando baixa absorção destes pelas plantas. O Carbono Orgânico Total (COT) variou de 1,03 a 4,77%. A razão molar C/N eisotópicas 13C e 15C indicaram que um percentual considerável da matéria orgânica é de fonte terrestre, sendo proveniente da vegetaçãodo próprio manguezal.Palavras-chave: Metais, matéria orgânica, isótopos. ABSTRACTBIOGEOCHEMISTRY OF ORGANIC MATTER AND METALS IN A MANGROVE AT THE URBAN ESTUARINE AREA, BAHIA, BRAZIL -The biogeochemical behavior of carbon, nitrogen, phosphorus, metals and natural tracer isotopes of organic matter were studied insediments and plants at 15 points in the estuary of the Passa Vaca River, located in urban area of Salvador, Bahia, Brazil. Sedimentelements were the order: Fe> Al> Ca> P> Na> Cu> K> Zn> Mn, for the specie Laguncularia racemosa (L.) Gaertn was observed: Na> Ca> K>Fe> Mn> Al> Zn> Cu, and Rhizophora mangle L: Na> Ca> K> Mn> Fe> Al> Zn> Cu. Correlations were also observed sediment/plant in theconcentration of elements evaluated. However, the concentration factors for heavy metals were below 1 indicating low absorption ofthese plants. The Total Organic Carbon (TOC) ranged from 1.03 to 4.77%. The molar ratio C / N and isotopic 13C and 15C indicated that asignificant percentage of organic matter is land-based sources, and from the mangrove vegetation itself.Keywords: Metals, organic matter, isotopes.