El crédito para la reactivación de la actividad agropecuaria en México, es­pecialmente en municipios marginados, es un elemento clave. Un factor determinante asociado al financiamiento rural es el costo de transacción para un crédito de largo plazo, el cual se estima pasó en los últimos 25 años del 0% a aproximadamente el 3% y debido, tanto a cambios en las políticas financiera, de precios y comercial, así como a los problemas de inseguridad en diversas regiones de México, las unidades de producción que acceden a un crédito han disminuido de manera significativa. En este contexto, el objetivo de esta investigación es analizar comparativamente las operaciones financieras del desaparecido Banrural (1975-2002) y de la Financiera Ru­ral (2002-2014), tránsito en el que se observa una reducción significativa del financiamiento público otorgado para las unidades de producción agropecuaria en México, en particular en los municipios de alta margina­ción. Para tal propósito, se cuantifican los costos de transacción del crédito rural desde 1988 hasta 2015, en el caso de los municipios de Apatzingán y Coalcomán del estado de Michoacán. Y se argumenta sobre la relevancia que el factor costo de transacción tiene en la merma del crédito desde la perspectiva de los actores locales. Se concluye que minimizar los costos de transacción del crédito rural mediante la instrumentación de mecanismos ágiles de operación crediticia, sin detrimento de la seguridad financiera, es una cuestión esencial y urgente, para evitar que una parte significativa del campo mexicano se mantenga improductivo y las condiciones de bienestar social de la población rural se sigan deteriorando.