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The aim of the present study was to estimate the genetic diversity within the samples of Mesosetum chaseae from the Embrapa Pantanal Germplasm Bank (BAG) and assess how they are genetically structured to guide proposals to: 1) identify native forages for further testing to measure their suitability for sowing in conjunction with or as an alternative to exotic forages, mainly Urochloa humidicola; and 2) improve the species M. chaseae with samples that are maintained in the BAG. Isozyme α-and β-esterases were analyzed in 10 accessions collected from different locations in the Nhecolândia sub-region of the Pantanal, and maintained in the BAG. Accessions A11, which showed the highest effective number of alleles, and A32 with the highest average values of expected and observed heterozygosity, were identified as warranting further study as possible options for sowing as pasture forages, as well as for use in recovering poor and degraded areas in the Pantanal region. A high level of population differentiation was detected among the 10 accessions, indicating that they form genetically structured populations and that all accessions are important samples of M. chaseae, which should be maintained in the BAG. Crosses between sample plants with the highest genetic distances are recommended to implement improvement plans with a prospect of broadening the genetic base of the species. ResumenEl objetivo del estudio fue estimar la diversidad genética entre las muestras de Mesosetum chaseae del Banco de Germoplasma (BAG) de Embrapa Pantanal y evaluar cómo están estructuradas genéticamente con el objeto de guiar propuestas para: 1) identificar un forraje nativo para estudios de su potencial como especie complementaria o alternativa a forrajes exóticos, sobre todo Urochloa humidicola; y 2) mejorar la especie M. chaseae con base en muestras disponibles en el BAG Pantanal. En un total de 10 muestras recolectadas en diferentes localidades de la subregión Nhecolândia del Pantanal, se analizaron las isoenzimas α-y ß-esterasas. Se identificaron las accesiones A11, que mostró el número efectivo más alto de alelos; y A32, que presentó los más altos valores promedio de heterocigosidad esperada y observada, como promisorias para trabajos de investigación adicionales con el objeto de desarrollar nuevas opciones tanto para pasturas como para recuperar áreas degradadas en la región del Pantanal. Se identificó un alto nivel de diferenciación poblacional entre las accesiones, lo que indica que las 10 accesiones estudiadas forman poblaciones genéticamente estructuradas y que todas son muestras importantes de M. chaseae, que por tanto deben ser conservadas en el Banco de Germoplasma de Embrapa Pantanal. Se recomiendan cruzamientos entre las muestras con las distancias genéticas más altas para implementar planes de mejoramiento con miras a ampliar la base genética de la especie.

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