Yoğun bakım ünitelerinde yatan hastalarda kateterizasyona bağlı olarak gelişen fungal enfeksiyonlar arasında en sık kan dolaşımı enfeksiyonları görülmektedir. Candida albicans endojen kaynaklı olmasından dolayı nozokomiyal fungal enfeksiyonlarda ilk sırada yer almaktadır. Antifungal tedaviye daha zor yanıt veren Candida tropicalis, Candida parapsilosis, Candida glabrata gibi albicans-dışı Candida türleriyle karsılaşma oranı hızla artmaktadır. Bu çalışmada, nozokomiyal potansiyeli bulunduğu bilinen C. parapsilosis suşlarının klonal yakınlıklarının rep-PCR (Repetitive Extragenic Palindromic Element-Polimeraz Zincir Reaksiyonu, bioMeriéux, Fransa) DiversiLab ® yöntemiyle belirlenmesi amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Ocak 2012 ve Haziran 2013 yılları arasında santral venöz kateterden alınan kan örneklerinden izole edilen 33 C. parapsilosis suşu çalışmaya dâhil edilmiştir. Klasik yöntemlerle tür tanısı yapılan suşların klonal ilişkileri rep-PCR DiversiLab ® sistemi ile belirlenmiştir. Bulgular: Rep-PCR DiversiLab ® sistemi ile yapılan klonal ilişki analizi sonucunda üç (A-C) farklı klon tespit edilmiş, A klonunun (%87.8, n=29) baskın tip olduğu belirlenmiştir. B klonuna ait 3 suş, C klonunda ise bir suş saptanmıştır. A klonu, reanimasyon ünitesi örneklerinin %48.2'sinden, pediyatri yoğun bakım ünitesi örneklerinin %20.6'sı, cerrahi yoğun bakım ünitesi örneklerinin %17.2'sinden ve dahiliye yoğun bakım ünitesi örneklerinin %13.7'sinden izole edilmiştir. İlk ve son suşun izolasyon tarihleri arasında on sekiz aylık süre olduğu belirlenmiştir. Sonuç: C. parapsilosis suşlarının servisler arası transfer edilen hastalar ve çapraz bulaşlar sonucu yayıldığı düşünülmüştür. Çalışmada kullanılan rep-PCR DiversiLab ® sisteminin epidemiyolojik çalışmalarda ve enfeksiyon kontrolünde kullanılabilecek kolay uygulanabilen, hızlı ve başarılı bir yöntem olduğu kanısına varılmıştır. Suşların hastane ortamındaki dağılımının klonal ilişki göstermesi, enfeksiyon kontrol önlemlerinin önemini bir kez daha vurgulamaktadır.
Fusarium species have gained importance as a cause of keratitis. The pathogenicity and virulence factors of genus Fusarium remain largely unknown. Several putative virulence factors have been reported for fungal pathogens, including biofilm formation, production of proteinases and other hydrolytic enzymes. It has been emphasized that Fusarium species are generally resistant to antifungals but the resistance may vary depending on the species and even according to the isolate. For this reason, pathogenic features and antifungal susceptibility of the clinical isolates gained importance for the management of keratitis cases. The aim of this study was to identify clinical Fusarium isolates, to evaluate their virulence factors and to show antifungal susceptibility patterns. The identification of Fusarium was made on genus level isolated from 25 keratitis cases. Among them, 13 of the isolates were identified by ITS sequencing on species complex level. The production of hemolytic activity, caseinase, esterase, proteinase and phospholipase activity were investigated in 13 of the isolates. Biofilm production was searched among all 25 isolates. Galleria mellonella larvae was used as in vivo infection model. Antifungal susceptibility for amphotericin B, itraconazole, voriconazole and posaconazole was performed according to the Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) M38-A2 microdilution assay guidelines. As the subcommittee on antifungal susceptibility tests did not determine the clinical resistance breakpoints (CBP) specific to Fusarium species complex, the epidemiological cut off values (ECV) were used for the interpretation of the minimum inhibitory concentration (MIC) values of the antifungal drugs. Isolates were identified as six F.oxysporum, six F.solani species complex and one F.brachygibbosum. One F.solani, one F.oxysporum were positive for hemolytic activity; all isolates were caseinase positive; three F.oxysporum and two F.solani isolate were esterase positive; one F.solani isolate was proteinase positive; five F.oxysporum and two F.solani isolates were phospholipase positive; biofilm activity was positive in 52% of the 25 isolates. The larvae survived for seven days after Fusarium inoculation in the G.mellonella larvae model. MIC range was 0.5-8 µg/ml for amphotericin B, 2-32 µg/ml for itraconazole, 0.5-8 µg/ml for voriconazole, 0.5-16 µg/ml for posaconazole and according to the ECV values F.solani and F.oxysporum isolates were determined as wild type for four antifungal agents. As a result, it was shown that Fusarium isolates have some virulence factors, there was a concordance between in vitro virulence properties and in vivo virulence characteristics and some of the isolates were classified as antifungal susceptible wild type isolates.
scite is a Brooklyn-based organization that helps researchers better discover and understand research articles through Smart Citations–citations that display the context of the citation and describe whether the article provides supporting or contrasting evidence. scite is used by students and researchers from around the world and is funded in part by the National Science Foundation and the National Institute on Drug Abuse of the National Institutes of Health.