RESUMO Os fungos filamentosos e leveduras podem estar associados a diferentes patologias no homem e animais. O leite e seus derivados contaminados com estes microrganismos podem constituir potenciais vias de transmissão de zoonoses a eles relacionadas. Foram analisadas 70 amostras de leite, sendo 50 de tanques de refrigeração, 10 de latões de propriedades de exploração leiteira e 10 de latões de distribuidores que comercializam leite informal, visando a comparação da qualidade destes produtos quanto à presença e quantidade de fungos. Foram isolados, em diferentes percentagens, fungos filamentosos e leveduras a partir de todas as amostras de leite das diferentes procedências: Candida spp. (C. krusei, C. guilliermondii, C. tropicalis, C. kefyr, dentreoutras), Geotrichum spp., Rhodotorula spp., Trichosporon spp., Aureobasidium spp., Penicillium spp., Acremonium spp., Chrysosporium spp., Mucor spp. e Aspergillus spp. Não houve diferença estatisticamente significante entre as medianas das quantidades de unidades formadoras de colônias de fungos/ mL de leite das diferentes procedências, indicando que o nível de contaminação por fungos nas amostras destas três origens foi similar. Pode-se verificar que em todas as amostras de leite cru havia a presença de fungos, todos passíveis agentes de micoses oportunísticas.