El objetivo del estudio fue determinar la frecuencia y factores asociados a la infección por Ehrlichia canis en perros. Se recolectaron muestras de sangre de 150 perros infestados con garrapatas en 10 consultorios veterinarios de la ciudad de Huánuco en Perú, los perros fueron seleccionados al azar sin distinción de raza, edad ni sexo. Se detectó anticuerpos contra Ehrlichia canis mediante inmunoensayo cromatográfico. El 51,3% de perros estuvieron infectados por Ehrlichia canis. En el análisis multivariado se encontraron asociados a la presencia Ehrlichia canis, el mal estado de salud del perro (p=0,049), un promedio mayor de infestación por garrapatas (p=0,018), perros de edad adulta (p=0,038). La frecuencia de Ehrlichia canis en perros de esta ciudad es alta. Se recomienda el control de la garrapata marrón del perro (Rhipicephalus sanguineus) vector de la Ehrlichia canis.