Los quistes ováricos complejos bilaterales en los recién nacidos son poco frecuentes y su reporte resulta de gran importancia para el conocimiento sobre el mejor manejo terapéutico.Objetivo: Describir el caso clínico de una recién nacida con diagnóstico de quistes ováricos complejos bilaterales y discutir las condiciones para el manejo conservador o quirúrgico según las características ecográficas del quiste.Caso Clínico: A las 35 semanas de edad gestacional se identificó mediante ultrasonido prenatal la presencia de masas quísticas en ambos anexos por lo que se decidió interrupción del embarazo por cesárea en la semana 37. Posterior al nacimiento, se corroboró la presencia de quistes ováricos bilaterales de 3,5 x 4,4 x 2,7 y 3,4 x 2,4 x 3,3 cm, derecho e izquierdo, respectivamente. El derecho con tabique de 1,4 mm y pared engrosada de 3 mm, hallazgos compatibles con quistes complejos. Al cuarto día de vida extrauterina se realizó aspiración evacuadora y destechamiento de la pared superior de ambos quistes con electrocauterio por vía laparoscópica, sin complicaciones. Se realizó el diagnóstico por anatomía patológica de cistoadenoma seroso de ovario.Conclusiones: Describimos un caso con adecuado diagnóstico prenatal e intervención quirúrgica laparoscópica exitosa de quiste ovárico bilateral > 4 cm. El diagnóstico prenatal es fundamental para un abordaje oportuno, según las características ecográficas del quiste: conservador o quirúrgico. Se recomienda la intervención quirúrgica neonatal en quistes de ovario simples > 4 cm, quistes complejos independientemente de su tamaño y aquellos que durante el manejo conservador evolucionen a quistes complejos.