Recent updates in comparative genomics among cereals have provided the opportunity to identify conserved orthologous set (COS) DNA sequences for cross-genome map-based cloning of candidate genes underpinning quantitative traits. New tools are described that are applicable to any cereal genome of interest, namely, alignment criterion for orthologous couples identification, as well as the Intron Spanning Marker software to automatically select intron-spanning primer pairs. In order to test the software, it was applied to the bread wheat genome, and 695 COS markers were assigned to 1,535 wheat loci (on average one marker/2.6 cM) based on 827 robust rice-wheat orthologs. Furthermore, 31 of the 695 COS markers were selected to fine map a pentosan viscosity quantitative trait loci (QTL) on wheat chromosome 7A. Among the 31 COS markers, 14 (45%) were polymorphic between the parental lines and 12 were mapped within the QTL confidence interval with one marker every 0.6 cM defining candidate genes among the rice orthologous region.

Diversos cultivares de Cynodon dactylon têm sido cultivados no Rio Grande do Sul para alimentação do rebanho leiteiro, na forma de pastejo ou feno. A rápida determinação do valor nutritivo dessas forrageiras pode ser útil para seu manejo e para o planejamento da dieta dos animais. Este trabalho teve como objetivo desenvolver curvas de calibração para análise do valor nutritivo de quatro cultivares de Cynodon (Tifton 68, Tifton 85, Florakirk, Coastcross), utilizando o método de reflectância no infravermelho proximal (NIRS). Foram utilizadas 129 amostras de forragem verde, coletadas e analisadas entre 1998 e 2001. Os coeficientes de determinação para proteína bruta, fibra insolúvel em detergente neutro, fibra insolúvel em detergente ácido, matéria seca, cálcio, fósforo, potássio e magnésio foram, respectivamente: 0,98; 0,97; 0,99; 1; 0,92; 0,97; 0,99 e 0,72%. Os erros-padrão de calibração foram de 0,38; 0,60; 0,35; 0,14; 0,02; 0,01; 0,05 e 0,01%, respectivamente. As equações obtidas foram consideradas de excelente resolução para todos os parâmetros estimados, o que indica a acurácia do método para a espécie avaliada.

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White clover is one of the most important forage legume species worldwide, playing an important role in Southern Brazil temperate cultivated pastures. This work was aimed to characterize the genetic variability of the USDA white clover core collection formed by 78 accessions representing 50 countries, together with two very well known cultivars (Huia and Ladino Regal), using RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) markers to produce genetic fingerprints. There were used DNA bulks formed by the extraction and mixture of 20 random individuals from each accession. Twenty four primers were used, which revealed from 3 to 29 bands, forming a total of 371 polymorphic bans and only one monomorphic, ranging from 50 to 3098 bp. The results showed a genetic similarity among the accessions, ranging from 0.18 to 0.58 (Jaccard's index), with an average of 0.24, allowing the identification of each individual accession using just three primers. The results also showed a large genetic variability within the white clover core collection, probably due to its reproduction mode and ploidy level, which could be used in plant breeding program.

RESUMO -Os métodos tradicionais de análise da qualidade nutricional de forragens são demorados e de custo elevado. O método da reflectância no infravermelho proximal apresenta-se uma alternativa que não utiliza reagentes, não é destrutivo e é extremamente rápido. No entanto, para que seja utilizado rotineiramente, faz-se necessário o desenvolvimento de curvas de calibração, obtidas por intermédio de equações matemáticas a partir dos resultados de ensaios laboratoriais. O presente trabalho foi desenvolvido com o objetivo de desenvolver curvas de calibração para silagem de milho, utilizando-se um total de 246 amostras, oriundas de diferentes regiões do Rio Grande do Sul. O material foi analisado quanto aos teores de proteína bruta (PB), matéria seca (MS), fibra em detergente ácido (FDA), fibra em detergente neutro (FDN) e minerais (Ca, K, Mg, P) pelos métodos analíticos de referência. As mesmas amostras foram analisadas em um espectrômetro, cuja leitura foi realizada nos comprimentos de onda de 1100 a 2500 nanômetros. Para a calibração, foi utilizado o tratamento matemático do programa Match e, posteriormente, análise de regressão, tendo como variáveis independentes os resultados das análises físico-químicas e, como variáveis dependentes, os resultados da reflectância no infravermelho proximal. A avaliação do grau de ajuste foi feita por intermédio dos coeficientes de determinação (R 2 ).A acurácia foi elevada (R 2 = 0,99) para PB, FDA, FDN e MS, indicando a validade do método na predição desses parâmetros em silagem de milho. Mesmo que o R 2 para determinação de minerais tenha variado de 0,92 a 0,94, ainda são necessários estudos detalhados do comportamento do espectro, para avaliar o tipo de complexo mineral formado e sua relação com o método físico-químico. Os resultados médios de PB, FDN, FDA e MS foram de 7,86; 60,66; 29,87 e 94,17%, respectivamente. Os resultados médios para Ca, P, K e Mg foram de 0,27; 0,21; 1,14 e 0,22%, respectivamente.Palavras-chave: métodos de análise de forragem, proteína, fibra, matéria seca, minerais Validation of the Near Infrared Reflectance Method for the Analysis of Corn SilageABSTRACT -Traditional analytical methods of assessing forage nutritional value are time-consuming and expensive. The near infrared reflectance method appears as an alternative that does not utilize chemicals, is not destructive and is extremely fast. However, in order to be used in a routinely basis, calibration curves have to be developed from laboratory results and mathematical equations. The objective of this paper was to develop calibration curves for corn silage, using a total of 246 samples collected in different regions of Rio Grande do Sul. The samples were analyzed using the reference methods to determine crude protein (CP), dry matter (DM), acid detergent fiber (ADF), neutral detergent fiber (NDF) and minerals (Ca, K, Mg and P). The same samples were also analyzed by spectroscopy, using a wave length region that ranges from 1100 to 2500 nm. Data was mathematically treated by the Match program and ...