Introducción: Durante la pandemia de COVID-19 se ha venido estudiando de manera paulatina la afectación del virus en las pacientes embarazadas, lo cual provocó un retraso en el deseo de lograr una concepción. Objetivos: Describir la incidencia de infección por SARS-CoV-2 en centros de fertilidad en México. Material y métodos: Es un estudio descriptivo, transversal, observacional, retrospectivo en tres clínicas de reproducción asistida en la Ciudad de México. Se incluyeron mujeres ovodonadoras y candidatas a procedimientos de reproducción asistida con prueba de PCR para SARS-CoV-2. Resultados: Se incluyeron 50 pacientes, 84% con infertilidad y 16% ovodonadoras con una media de edad de 35.4 ± 6.25 años. De las pacientes, 55% tenían edad materna avanzada, 59.5% infertilidad primaria y 40.5% secundaria, predominando como comorbilidad hipotiroidismo. Se encontraron cuatro pacientes con PCR positiva para SARS-CoV-2 (p = 0.041), tres en contacto con personas positivas (p = 0.003) y con síntomas en los últimos 15 días (p = 0.371). Conclusiones: La incidencia de infección por SARS-CoV-2 en los centros de fertilidad es significativamente baja. No hay que retrasar los procedimientos de reproducción asistida, deben procurarse siempre las máximas medidas de protección sanitaria tanto a las pacientes como al personal de los centros de fertilidad.